Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC83Q8IWF9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC83Q8IWF9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC83Q8IWF9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC83Q8IWF9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC83Q8IWF9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC83Q8IWF9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC83Q8IWF9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC83Q8IWF9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC83Q8IWF9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC83Q8IWF9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC83Q8IWF9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC83Q8IWF9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC83Q8IWF9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC83Q8IWF9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC83Q8IWF9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC83Q8IWF9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC83Q8IWF9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC83Q8IWF9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC83Q8IWF9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC83Q8IWF9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC83Q8IWF9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC83Q8IWF9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC83Q8IWF9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC83Q8IWF9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC83Q8IWF9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC83Q8IWF9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC83Q8IWF9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC83Q8IWF9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC83Q8IWF9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC83Q8IWF9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC83Q8IWF9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC83Q8IWF9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC83Q8IWF9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC83Q8IWF9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC83Q8IWF9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC83Q8IWF9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC83Q8IWF9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC83Q8IWF9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC83Q8IWF9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC83Q8IWF9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC83Q8IWF9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC83Q8IWF9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC83Q8IWF9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC83Q8IWF9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC83Q8IWF9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCDC83Q8IWF9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC83Q8IWF9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC83Q8IWF9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC83Q8IWF9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC83Q8IWF9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC83Q8IWF9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC83Q8IWF9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC83Q8IWF9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC83Q8IWF9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC83Q8IWF9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC83Q8IWF9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC83Q8IWF9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC83Q8IWF9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC83Q8IWF9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC83Q8IWF9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC83Q8IWF9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC83Q8IWF9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC83Q8IWF9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC83Q8IWF9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC83Q8IWF9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC83Q8IWF9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC83Q8IWF9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC83Q8IWF9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC83Q8IWF9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC83Q8IWF9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC83Q8IWF9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC83Q8IWF9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC83Q8IWF9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC83Q8IWF9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC83Q8IWF9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC83Q8IWF9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC83Q8IWF9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC83Q8IWF9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CCDC83Q8IWF9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC83Q8IWF9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC83Q8IWF9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC83Q8IWF9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC83Q8IWF9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC83Q8IWF9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC83Q8IWF9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC83Q8IWF9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC83Q8IWF9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC83Q8IWF9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC83Q8IWF9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC83Q8IWF9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC83Q8IWF9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC83Q8IWF9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC83Q8IWF9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC83Q8IWF9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC83Q8IWF9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC83Q8IWF9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC83Q8IWF9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC83Q8IWF9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC83Q8IWF9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms