Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM8

SLC22A9, Solute carrier family 22 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A9Q8IVM8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC22A9Q8IVM8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC22A9Q8IVM8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SLC22A9Q8IVM8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC22A9Q8IVM8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC22A9Q8IVM8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC22A9Q8IVM8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC22A9Q8IVM8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC22A9Q8IVM8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC22A9Q8IVM8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC22A9Q8IVM8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC22A9Q8IVM8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC22A9Q8IVM8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC22A9Q8IVM8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC22A9Q8IVM8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC22A9Q8IVM8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC22A9Q8IVM8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC22A9Q8IVM8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC22A9Q8IVM8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC22A9Q8IVM8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC22A9Q8IVM8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC22A9Q8IVM8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC22A9Q8IVM8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC22A9Q8IVM8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC22A9Q8IVM8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC22A9Q8IVM8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC22A9Q8IVM8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC22A9Q8IVM8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC22A9Q8IVM8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC22A9Q8IVM8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC22A9Q8IVM8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC22A9Q8IVM8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC22A9Q8IVM8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC22A9Q8IVM8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC22A9Q8IVM8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC22A9Q8IVM8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC22A9Q8IVM8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC22A9Q8IVM8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC22A9Q8IVM8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC22A9Q8IVM8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC22A9Q8IVM8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC22A9Q8IVM8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC22A9Q8IVM8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC22A9Q8IVM8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC22A9Q8IVM8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC22A9Q8IVM8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC22A9Q8IVM8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC22A9Q8IVM8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC22A9Q8IVM8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC22A9Q8IVM8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC22A9Q8IVM8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC22A9Q8IVM8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC22A9Q8IVM8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC22A9Q8IVM8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC22A9Q8IVM8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC22A9Q8IVM8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC22A9Q8IVM8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC22A9Q8IVM8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC22A9Q8IVM8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC22A9Q8IVM8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC22A9Q8IVM8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC22A9Q8IVM8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC22A9Q8IVM8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC22A9Q8IVM8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC22A9Q8IVM8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC22A9Q8IVM8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC22A9Q8IVM8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC22A9Q8IVM8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC22A9Q8IVM8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC22A9Q8IVM8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms