Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV01

SYT12, Synaptotagmin-12, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12Q8IV01 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT12Q8IV01 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT12Q8IV01 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT12Q8IV01 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT12Q8IV01 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT12Q8IV01 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT12Q8IV01 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT12Q8IV01 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT12Q8IV01 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT12Q8IV01 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT12Q8IV01 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT12Q8IV01 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT12Q8IV01 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SYT12Q8IV01 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYT12Q8IV01 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT12Q8IV01 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT12Q8IV01 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT12Q8IV01 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT12Q8IV01 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT12Q8IV01 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT12Q8IV01 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT12Q8IV01 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYT12Q8IV01 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYT12Q8IV01 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SYT12Q8IV01 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYT12Q8IV01 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYT12Q8IV01 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYT12Q8IV01 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYT12Q8IV01 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYT12Q8IV01 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYT12Q8IV01 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYT12Q8IV01 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT12Q8IV01 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT12Q8IV01 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT12Q8IV01 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT12Q8IV01 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT12Q8IV01 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT12Q8IV01 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT12Q8IV01 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYT12Q8IV01 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SYT12Q8IV01 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms