Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUR6

CREBRF, CREB3 regulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREBRFQ8IUR6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CREBRFQ8IUR6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CREBRFQ8IUR6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CREBRFQ8IUR6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CREBRFQ8IUR6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CREBRFQ8IUR6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CREBRFQ8IUR6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CREBRFQ8IUR6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CREBRFQ8IUR6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CREBRFQ8IUR6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CREBRFQ8IUR6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CREBRFQ8IUR6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CREBRFQ8IUR6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CREBRFQ8IUR6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CREBRFQ8IUR6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CREBRFQ8IUR6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CREBRFQ8IUR6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CREBRFQ8IUR6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CREBRFQ8IUR6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CREBRFQ8IUR6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CREBRFQ8IUR6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CREBRFQ8IUR6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CREBRFQ8IUR6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CREBRFQ8IUR6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CREBRFQ8IUR6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CREBRFQ8IUR6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CREBRFQ8IUR6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CREBRFQ8IUR6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CREBRFQ8IUR6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CREBRFQ8IUR6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CREBRFQ8IUR6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CREBRFQ8IUR6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CREBRFQ8IUR6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CREBRFQ8IUR6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CREBRFQ8IUR6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CREBRFQ8IUR6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CREBRFQ8IUR6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CREBRFQ8IUR6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CREBRFQ8IUR6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CREBRFQ8IUR6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CREBRFQ8IUR6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CREBRFQ8IUR6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CREBRFQ8IUR6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CREBRFQ8IUR6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CREBRFQ8IUR6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CREBRFQ8IUR6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CREBRFQ8IUR6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CREBRFQ8IUR6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CREBRFQ8IUR6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CREBRFQ8IUR6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CREBRFQ8IUR6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CREBRFQ8IUR6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CREBRFQ8IUR6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CREBRFQ8IUR6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CREBRFQ8IUR6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CREBRFQ8IUR6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CREBRFQ8IUR6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CREBRFQ8IUR6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CREBRFQ8IUR6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CREBRFQ8IUR6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CREBRFQ8IUR6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CREBRFQ8IUR6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CREBRFQ8IUR6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CREBRFQ8IUR6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CREBRFQ8IUR6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CREBRFQ8IUR6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CREBRFQ8IUR6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.7 ms