Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ep400Q8CHI8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ep400Q8CHI8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ep400Q8CHI8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ep400Q8CHI8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ep400Q8CHI8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ep400Q8CHI8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ep400Q8CHI8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ep400Q8CHI8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ep400Q8CHI8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ep400Q8CHI8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ep400Q8CHI8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ep400Q8CHI8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ep400Q8CHI8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ep400Q8CHI8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ep400Q8CHI8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ep400Q8CHI8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ep400Q8CHI8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ep400Q8CHI8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ep400Q8CHI8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ep400Q8CHI8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ep400Q8CHI8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ep400Q8CHI8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ep400Q8CHI8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ep400Q8CHI8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ep400Q8CHI8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ep400Q8CHI8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ep400Q8CHI8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ep400Q8CHI8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ep400Q8CHI8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ep400Q8CHI8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ep400Q8CHI8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ep400Q8CHI8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ep400Q8CHI8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ep400Q8CHI8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ep400Q8CHI8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ep400Q8CHI8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ep400Q8CHI8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ep400Q8CHI8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ep400Q8CHI8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ep400Q8CHI8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ep400Q8CHI8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ep400Q8CHI8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ep400Q8CHI8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ep400Q8CHI8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ep400Q8CHI8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ep400Q8CHI8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ep400Q8CHI8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ep400Q8CHI8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ep400Q8CHI8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ep400Q8CHI8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ep400Q8CHI8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ep400Q8CHI8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ep400Q8CHI8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ep400Q8CHI8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ep400Q8CHI8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ep400Q8CHI8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ep400Q8CHI8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ep400Q8CHI8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ep400Q8CHI8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ep400Q8CHI8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ep400Q8CHI8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ep400Q8CHI8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ep400Q8CHI8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ep400Q8CHI8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ep400Q8CHI8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ep400Q8CHI8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ep400Q8CHI8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ep400Q8CHI8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ep400Q8CHI8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ep400Q8CHI8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ep400Q8CHI8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
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