Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEF8

Rnf222, RING finger protein 222, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf222Q8CEF8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf222Q8CEF8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf222Q8CEF8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf222Q8CEF8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf222Q8CEF8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf222Q8CEF8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf222Q8CEF8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf222Q8CEF8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf222Q8CEF8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf222Q8CEF8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf222Q8CEF8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf222Q8CEF8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf222Q8CEF8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf222Q8CEF8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf222Q8CEF8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf222Q8CEF8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf222Q8CEF8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf222Q8CEF8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf222Q8CEF8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf222Q8CEF8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf222Q8CEF8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf222Q8CEF8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf222Q8CEF8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf222Q8CEF8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf222Q8CEF8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf222Q8CEF8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf222Q8CEF8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf222Q8CEF8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf222Q8CEF8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf222Q8CEF8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf222Q8CEF8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf222Q8CEF8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf222Q8CEF8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf222Q8CEF8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf222Q8CEF8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf222Q8CEF8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf222Q8CEF8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf222Q8CEF8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf222Q8CEF8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf222Q8CEF8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf222Q8CEF8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf222Q8CEF8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf222Q8CEF8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf222Q8CEF8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf222Q8CEF8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf222Q8CEF8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf222Q8CEF8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf222Q8CEF8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf222Q8CEF8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf222Q8CEF8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf222Q8CEF8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf222Q8CEF8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf222Q8CEF8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf222Q8CEF8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf222Q8CEF8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf222Q8CEF8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf222Q8CEF8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf222Q8CEF8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf222Q8CEF8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rnf222Q8CEF8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf222Q8CEF8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf222Q8CEF8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf222Q8CEF8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf222Q8CEF8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf222Q8CEF8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf222Q8CEF8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf222Q8CEF8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf222Q8CEF8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf222Q8CEF8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf222Q8CEF8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf222Q8CEF8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf222Q8CEF8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnf222Q8CEF8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms