Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam228aQ8CDW1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fam228aQ8CDW1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam228aQ8CDW1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam228aQ8CDW1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam228aQ8CDW1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam228aQ8CDW1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam228aQ8CDW1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fam228aQ8CDW1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fam228aQ8CDW1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam228aQ8CDW1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Fam228aQ8CDW1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam228aQ8CDW1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fam228aQ8CDW1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam228aQ8CDW1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam228aQ8CDW1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fam228aQ8CDW1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam228aQ8CDW1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam228aQ8CDW1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam228aQ8CDW1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam228aQ8CDW1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fam228aQ8CDW1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fam228aQ8CDW1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam228aQ8CDW1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam228aQ8CDW1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fam228aQ8CDW1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam228aQ8CDW1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam228aQ8CDW1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam228aQ8CDW1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam228aQ8CDW1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fam228aQ8CDW1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam228aQ8CDW1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam228aQ8CDW1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam228aQ8CDW1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam228aQ8CDW1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fam228aQ8CDW1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam228aQ8CDW1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam228aQ8CDW1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam228aQ8CDW1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam228aQ8CDW1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fam228aQ8CDW1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam228aQ8CDW1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam228aQ8CDW1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam228aQ8CDW1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam228aQ8CDW1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam228aQ8CDW1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fam228aQ8CDW1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fam228aQ8CDW1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam228aQ8CDW1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam228aQ8CDW1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam228aQ8CDW1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam228aQ8CDW1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam228aQ8CDW1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam228aQ8CDW1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam228aQ8CDW1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam228aQ8CDW1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam228aQ8CDW1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam228aQ8CDW1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam228aQ8CDW1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam228aQ8CDW1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam228aQ8CDW1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam228aQ8CDW1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam228aQ8CDW1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam228aQ8CDW1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam228aQ8CDW1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam228aQ8CDW1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam228aQ8CDW1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam228aQ8CDW1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam228aQ8CDW1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam228aQ8CDW1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam228aQ8CDW1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam228aQ8CDW1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam228aQ8CDW1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam228aQ8CDW1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam228aQ8CDW1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam228aQ8CDW1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam228aQ8CDW1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam228aQ8CDW1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam228aQ8CDW1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam228aQ8CDW1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam228aQ8CDW1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam228aQ8CDW1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam228aQ8CDW1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam228aQ8CDW1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam228aQ8CDW1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam228aQ8CDW1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam228aQ8CDW1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam228aQ8CDW1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam228aQ8CDW1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam228aQ8CDW1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam228aQ8CDW1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam228aQ8CDW1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam228aQ8CDW1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam228aQ8CDW1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam228aQ8CDW1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam228aQ8CDW1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam228aQ8CDW1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam228aQ8CDW1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam228aQ8CDW1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam228aQ8CDW1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms