Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDU6

Hectd2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD2, mousemouse

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd2Q8CDU6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hectd2Q8CDU6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hectd2Q8CDU6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hectd2Q8CDU6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hectd2Q8CDU6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hectd2Q8CDU6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hectd2Q8CDU6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hectd2Q8CDU6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hectd2Q8CDU6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Hectd2Q8CDU6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hectd2Q8CDU6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hectd2Q8CDU6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hectd2Q8CDU6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hectd2Q8CDU6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hectd2Q8CDU6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hectd2Q8CDU6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hectd2Q8CDU6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hectd2Q8CDU6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hectd2Q8CDU6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hectd2Q8CDU6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hectd2Q8CDU6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hectd2Q8CDU6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hectd2Q8CDU6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hectd2Q8CDU6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Hectd2Q8CDU6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hectd2Q8CDU6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hectd2Q8CDU6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hectd2Q8CDU6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hectd2Q8CDU6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hectd2Q8CDU6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hectd2Q8CDU6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hectd2Q8CDU6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hectd2Q8CDU6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hectd2Q8CDU6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hectd2Q8CDU6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hectd2Q8CDU6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hectd2Q8CDU6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hectd2Q8CDU6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hectd2Q8CDU6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hectd2Q8CDU6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hectd2Q8CDU6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hectd2Q8CDU6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hectd2Q8CDU6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hectd2Q8CDU6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hectd2Q8CDU6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hectd2Q8CDU6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hectd2Q8CDU6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hectd2Q8CDU6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hectd2Q8CDU6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hectd2Q8CDU6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hectd2Q8CDU6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hectd2Q8CDU6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hectd2Q8CDU6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hectd2Q8CDU6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hectd2Q8CDU6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hectd2Q8CDU6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hectd2Q8CDU6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hectd2Q8CDU6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hectd2Q8CDU6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hectd2Q8CDU6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hectd2Q8CDU6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hectd2Q8CDU6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hectd2Q8CDU6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hectd2Q8CDU6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hectd2Q8CDU6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hectd2Q8CDU6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hectd2Q8CDU6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hectd2Q8CDU6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hectd2Q8CDU6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hectd2Q8CDU6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hectd2Q8CDU6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hectd2Q8CDU6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms