Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCX5

Krt222, Keratin-like protein KRT222, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt222Q8CCX5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt222Q8CCX5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt222Q8CCX5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt222Q8CCX5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt222Q8CCX5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt222Q8CCX5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt222Q8CCX5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt222Q8CCX5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt222Q8CCX5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt222Q8CCX5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt222Q8CCX5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt222Q8CCX5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt222Q8CCX5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt222Q8CCX5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt222Q8CCX5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt222Q8CCX5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt222Q8CCX5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt222Q8CCX5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt222Q8CCX5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt222Q8CCX5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt222Q8CCX5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt222Q8CCX5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt222Q8CCX5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt222Q8CCX5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt222Q8CCX5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt222Q8CCX5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt222Q8CCX5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt222Q8CCX5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt222Q8CCX5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt222Q8CCX5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt222Q8CCX5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt222Q8CCX5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt222Q8CCX5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt222Q8CCX5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt222Q8CCX5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt222Q8CCX5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt222Q8CCX5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt222Q8CCX5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt222Q8CCX5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt222Q8CCX5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt222Q8CCX5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt222Q8CCX5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt222Q8CCX5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt222Q8CCX5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt222Q8CCX5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt222Q8CCX5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt222Q8CCX5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt222Q8CCX5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt222Q8CCX5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt222Q8CCX5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt222Q8CCX5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt222Q8CCX5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt222Q8CCX5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt222Q8CCX5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt222Q8CCX5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt222Q8CCX5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt222Q8CCX5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt222Q8CCX5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt222Q8CCX5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt222Q8CCX5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt222Q8CCX5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt222Q8CCX5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt222Q8CCX5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt222Q8CCX5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt222Q8CCX5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt222Q8CCX5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt222Q8CCX5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt222Q8CCX5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt222Q8CCX5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt222Q8CCX5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt222Q8CCX5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt222Q8CCX5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt222Q8CCX5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt222Q8CCX5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt222Q8CCX5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt222Q8CCX5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt222Q8CCX5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt222Q8CCX5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt222Q8CCX5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt222Q8CCX5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt222Q8CCX5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt222Q8CCX5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt222Q8CCX5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt222Q8CCX5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt222Q8CCX5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt222Q8CCX5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt222Q8CCX5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt222Q8CCX5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt222Q8CCX5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt222Q8CCX5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt222Q8CCX5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt222Q8CCX5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt222Q8CCX5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt222Q8CCX5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt222Q8CCX5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt222Q8CCX5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt222Q8CCX5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt222Q8CCX5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt222Q8CCX5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt222Q8CCX5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms