Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacnb2Q8CC27 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacnb2Q8CC27 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacnb2Q8CC27 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacnb2Q8CC27 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacnb2Q8CC27 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacnb2Q8CC27 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacnb2Q8CC27 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacnb2Q8CC27 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacnb2Q8CC27 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacnb2Q8CC27 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacnb2Q8CC27 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacnb2Q8CC27 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacnb2Q8CC27 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacnb2Q8CC27 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacnb2Q8CC27 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacnb2Q8CC27 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacnb2Q8CC27 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cacnb2Q8CC27 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacnb2Q8CC27 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacnb2Q8CC27 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cacnb2Q8CC27 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cacnb2Q8CC27 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacnb2Q8CC27 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacnb2Q8CC27 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacnb2Q8CC27 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacnb2Q8CC27 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacnb2Q8CC27 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacnb2Q8CC27 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacnb2Q8CC27 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacnb2Q8CC27 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacnb2Q8CC27 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacnb2Q8CC27 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacnb2Q8CC27 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacnb2Q8CC27 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacnb2Q8CC27 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacnb2Q8CC27 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacnb2Q8CC27 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacnb2Q8CC27 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacnb2Q8CC27 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacnb2Q8CC27 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacnb2Q8CC27 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacnb2Q8CC27 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacnb2Q8CC27 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cacnb2Q8CC27 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cacnb2Q8CC27 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacnb2Q8CC27 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacnb2Q8CC27 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacnb2Q8CC27 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacnb2Q8CC27 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacnb2Q8CC27 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacnb2Q8CC27 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacnb2Q8CC27 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacnb2Q8CC27 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacnb2Q8CC27 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cacnb2Q8CC27 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cacnb2Q8CC27 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacnb2Q8CC27 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacnb2Q8CC27 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacnb2Q8CC27 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cacnb2Q8CC27 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacnb2Q8CC27 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacnb2Q8CC27 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacnb2Q8CC27 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cacnb2Q8CC27 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cacnb2Q8CC27 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacnb2Q8CC27 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cacnb2Q8CC27 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacnb2Q8CC27 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacnb2Q8CC27 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cacnb2Q8CC27 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacnb2Q8CC27 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cacnb2Q8CC27 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms