Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC21

Ttc19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc19Q8CC21 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
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Ttc19Q8CC21 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Ttc19Q8CC21 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
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Ttc19Q8CC21 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
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Ttc19Q8CC21 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ttc19Q8CC21 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
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Ttc19Q8CC21 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
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Ttc19Q8CC21 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ttc19Q8CC21 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
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Ttc19Q8CC21 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Ttc19Q8CC21 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
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Ttc19Q8CC21 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
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Ttc19Q8CC21 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Ttc19Q8CC21 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ttc19Q8CC21 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
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Ttc19Q8CC21 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ttc19Q8CC21 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ttc19Q8CC21 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
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Ttc19Q8CC21 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ttc19Q8CC21 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ttc19Q8CC21 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ttc19Q8CC21 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttc19Q8CC21 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttc19Q8CC21 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ttc19Q8CC21 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ttc19Q8CC21 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttc19Q8CC21 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ttc19Q8CC21 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttc19Q8CC21 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ttc19Q8CC21 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ttc19Q8CC21 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttc19Q8CC21 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms