Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB96

Rassf4, Ras association domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf4Q8CB96 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rassf4Q8CB96 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rassf4Q8CB96 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rassf4Q8CB96 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rassf4Q8CB96 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rassf4Q8CB96 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rassf4Q8CB96 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rassf4Q8CB96 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rassf4Q8CB96 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rassf4Q8CB96 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rassf4Q8CB96 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rassf4Q8CB96 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rassf4Q8CB96 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rassf4Q8CB96 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rassf4Q8CB96 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rassf4Q8CB96 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rassf4Q8CB96 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rassf4Q8CB96 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rassf4Q8CB96 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rassf4Q8CB96 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rassf4Q8CB96 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rassf4Q8CB96 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rassf4Q8CB96 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rassf4Q8CB96 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rassf4Q8CB96 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rassf4Q8CB96 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rassf4Q8CB96 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rassf4Q8CB96 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rassf4Q8CB96 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rassf4Q8CB96 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rassf4Q8CB96 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rassf4Q8CB96 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rassf4Q8CB96 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rassf4Q8CB96 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rassf4Q8CB96 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rassf4Q8CB96 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rassf4Q8CB96 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rassf4Q8CB96 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rassf4Q8CB96 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rassf4Q8CB96 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rassf4Q8CB96 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rassf4Q8CB96 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rassf4Q8CB96 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rassf4Q8CB96 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rassf4Q8CB96 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rassf4Q8CB96 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rassf4Q8CB96 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rassf4Q8CB96 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rassf4Q8CB96 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rassf4Q8CB96 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rassf4Q8CB96 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rassf4Q8CB96 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rassf4Q8CB96 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rassf4Q8CB96 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rassf4Q8CB96 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rassf4Q8CB96 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rassf4Q8CB96 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rassf4Q8CB96 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rassf4Q8CB96 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rassf4Q8CB96 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Rassf4Q8CB96 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rassf4Q8CB96 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rassf4Q8CB96 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rassf4Q8CB96 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rassf4Q8CB96 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rassf4Q8CB96 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rassf4Q8CB96 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rassf4Q8CB96 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rassf4Q8CB96 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rassf4Q8CB96 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rassf4Q8CB96 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rassf4Q8CB96 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rassf4Q8CB96 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rassf4Q8CB96 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rassf4Q8CB96 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rassf4Q8CB96 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rassf4Q8CB96 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rassf4Q8CB96 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rassf4Q8CB96 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rassf4Q8CB96 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rassf4Q8CB96 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rassf4Q8CB96 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rassf4Q8CB96 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rassf4Q8CB96 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rassf4Q8CB96 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rassf4Q8CB96 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rassf4Q8CB96 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rassf4Q8CB96 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rassf4Q8CB96 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rassf4Q8CB96 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rassf4Q8CB96 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rassf4Q8CB96 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rassf4Q8CB96 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rassf4Q8CB96 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rassf4Q8CB96 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rassf4Q8CB96 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rassf4Q8CB96 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rassf4Q8CB96 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rassf4Q8CB96 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rassf4Q8CB96 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms