Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4J0

Ccdc60, Coiled-coil domain-containing protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc60Q8C4J0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc60Q8C4J0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc60Q8C4J0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc60Q8C4J0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc60Q8C4J0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc60Q8C4J0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc60Q8C4J0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc60Q8C4J0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc60Q8C4J0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc60Q8C4J0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc60Q8C4J0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc60Q8C4J0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc60Q8C4J0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc60Q8C4J0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc60Q8C4J0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc60Q8C4J0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc60Q8C4J0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc60Q8C4J0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc60Q8C4J0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc60Q8C4J0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc60Q8C4J0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ccdc60Q8C4J0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc60Q8C4J0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc60Q8C4J0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc60Q8C4J0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc60Q8C4J0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc60Q8C4J0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc60Q8C4J0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc60Q8C4J0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc60Q8C4J0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc60Q8C4J0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc60Q8C4J0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc60Q8C4J0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ccdc60Q8C4J0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc60Q8C4J0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc60Q8C4J0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc60Q8C4J0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc60Q8C4J0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc60Q8C4J0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc60Q8C4J0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc60Q8C4J0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc60Q8C4J0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc60Q8C4J0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc60Q8C4J0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc60Q8C4J0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc60Q8C4J0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc60Q8C4J0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc60Q8C4J0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc60Q8C4J0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc60Q8C4J0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc60Q8C4J0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc60Q8C4J0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc60Q8C4J0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc60Q8C4J0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc60Q8C4J0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc60Q8C4J0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc60Q8C4J0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc60Q8C4J0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc60Q8C4J0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc60Q8C4J0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc60Q8C4J0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc60Q8C4J0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc60Q8C4J0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc60Q8C4J0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc60Q8C4J0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc60Q8C4J0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc60Q8C4J0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc60Q8C4J0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc60Q8C4J0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc60Q8C4J0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc60Q8C4J0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc60Q8C4J0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc60Q8C4J0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc60Q8C4J0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc60Q8C4J0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc60Q8C4J0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc60Q8C4J0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc60Q8C4J0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc60Q8C4J0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc60Q8C4J0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc60Q8C4J0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc60Q8C4J0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc60Q8C4J0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc60Q8C4J0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc60Q8C4J0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc60Q8C4J0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc60Q8C4J0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc60Q8C4J0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc60Q8C4J0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc60Q8C4J0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc60Q8C4J0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc60Q8C4J0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc60Q8C4J0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc60Q8C4J0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc60Q8C4J0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc60Q8C4J0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc60Q8C4J0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc60Q8C4J0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc60Q8C4J0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc60Q8C4J0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms