Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWW9

Pkn2, Serine/threonine-protein kinase N2, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn2Q8BWW9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pkn2Q8BWW9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pkn2Q8BWW9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pkn2Q8BWW9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkn2Q8BWW9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pkn2Q8BWW9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkn2Q8BWW9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkn2Q8BWW9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkn2Q8BWW9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkn2Q8BWW9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pkn2Q8BWW9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkn2Q8BWW9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkn2Q8BWW9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pkn2Q8BWW9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkn2Q8BWW9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pkn2Q8BWW9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkn2Q8BWW9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Pkn2Q8BWW9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pkn2Q8BWW9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkn2Q8BWW9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkn2Q8BWW9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkn2Q8BWW9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkn2Q8BWW9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Pkn2Q8BWW9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkn2Q8BWW9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkn2Q8BWW9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pkn2Q8BWW9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkn2Q8BWW9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkn2Q8BWW9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkn2Q8BWW9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkn2Q8BWW9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pkn2Q8BWW9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkn2Q8BWW9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pkn2Q8BWW9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pkn2Q8BWW9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pkn2Q8BWW9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkn2Q8BWW9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkn2Q8BWW9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkn2Q8BWW9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pkn2Q8BWW9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkn2Q8BWW9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkn2Q8BWW9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkn2Q8BWW9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pkn2Q8BWW9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkn2Q8BWW9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkn2Q8BWW9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkn2Q8BWW9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pkn2Q8BWW9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkn2Q8BWW9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkn2Q8BWW9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkn2Q8BWW9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pkn2Q8BWW9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Pkn2Q8BWW9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkn2Q8BWW9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkn2Q8BWW9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pkn2Q8BWW9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pkn2Q8BWW9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkn2Q8BWW9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkn2Q8BWW9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pkn2Q8BWW9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkn2Q8BWW9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkn2Q8BWW9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkn2Q8BWW9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkn2Q8BWW9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pkn2Q8BWW9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkn2Q8BWW9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pkn2Q8BWW9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pkn2Q8BWW9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkn2Q8BWW9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkn2Q8BWW9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkn2Q8BWW9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pkn2Q8BWW9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkn2Q8BWW9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pkn2Q8BWW9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkn2Q8BWW9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pkn2Q8BWW9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkn2Q8BWW9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkn2Q8BWW9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkn2Q8BWW9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pkn2Q8BWW9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkn2Q8BWW9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pkn2Q8BWW9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkn2Q8BWW9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pkn2Q8BWW9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkn2Q8BWW9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkn2Q8BWW9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkn2Q8BWW9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pkn2Q8BWW9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkn2Q8BWW9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pkn2Q8BWW9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkn2Q8BWW9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkn2Q8BWW9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkn2Q8BWW9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkn2Q8BWW9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkn2Q8BWW9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkn2Q8BWW9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkn2Q8BWW9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pkn2Q8BWW9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkn2Q8BWW9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pkn2Q8BWW9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms