Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lmod1Q8BVA4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lmod1Q8BVA4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lmod1Q8BVA4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmod1Q8BVA4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmod1Q8BVA4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Lmod1Q8BVA4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lmod1Q8BVA4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lmod1Q8BVA4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lmod1Q8BVA4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lmod1Q8BVA4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lmod1Q8BVA4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lmod1Q8BVA4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lmod1Q8BVA4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Lmod1Q8BVA4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Lmod1Q8BVA4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Lmod1Q8BVA4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Lmod1Q8BVA4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lmod1Q8BVA4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Lmod1Q8BVA4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Lmod1Q8BVA4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lmod1Q8BVA4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmod1Q8BVA4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmod1Q8BVA4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmod1Q8BVA4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmod1Q8BVA4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmod1Q8BVA4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmod1Q8BVA4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmod1Q8BVA4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmod1Q8BVA4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmod1Q8BVA4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmod1Q8BVA4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmod1Q8BVA4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmod1Q8BVA4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmod1Q8BVA4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lmod1Q8BVA4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lmod1Q8BVA4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lmod1Q8BVA4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lmod1Q8BVA4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lmod1Q8BVA4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmod1Q8BVA4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmod1Q8BVA4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmod1Q8BVA4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Lmod1Q8BVA4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Lmod1Q8BVA4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmod1Q8BVA4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmod1Q8BVA4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmod1Q8BVA4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmod1Q8BVA4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmod1Q8BVA4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lmod1Q8BVA4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lmod1Q8BVA4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Lmod1Q8BVA4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lmod1Q8BVA4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lmod1Q8BVA4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lmod1Q8BVA4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lmod1Q8BVA4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lmod1Q8BVA4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lmod1Q8BVA4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lmod1Q8BVA4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lmod1Q8BVA4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmod1Q8BVA4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmod1Q8BVA4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmod1Q8BVA4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmod1Q8BVA4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmod1Q8BVA4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmod1Q8BVA4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmod1Q8BVA4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmod1Q8BVA4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmod1Q8BVA4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Lmod1Q8BVA4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Lmod1Q8BVA4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lmod1Q8BVA4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lmod1Q8BVA4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Lmod1Q8BVA4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Lmod1Q8BVA4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lmod1Q8BVA4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Lmod1Q8BVA4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lmod1Q8BVA4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lmod1Q8BVA4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lmod1Q8BVA4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lmod1Q8BVA4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Lmod1Q8BVA4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lmod1Q8BVA4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lmod1Q8BVA4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lmod1Q8BVA4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lmod1Q8BVA4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmod1Q8BVA4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmod1Q8BVA4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmod1Q8BVA4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lmod1Q8BVA4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Lmod1Q8BVA4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Lmod1Q8BVA4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmod1Q8BVA4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lmod1Q8BVA4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmod1Q8BVA4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmod1Q8BVA4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmod1Q8BVA4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmod1Q8BVA4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lmod1Q8BVA4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms