Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU88

Mrpl22, 39S ribosomal protein L22, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl22Q8BU88 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mrpl22Q8BU88 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl22Q8BU88 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mrpl22Q8BU88 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl22Q8BU88 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl22Q8BU88 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mrpl22Q8BU88 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrpl22Q8BU88 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrpl22Q8BU88 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrpl22Q8BU88 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mrpl22Q8BU88 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mrpl22Q8BU88 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl22Q8BU88 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mrpl22Q8BU88 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl22Q8BU88 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl22Q8BU88 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl22Q8BU88 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mrpl22Q8BU88 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl22Q8BU88 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl22Q8BU88 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl22Q8BU88 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mrpl22Q8BU88 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mrpl22Q8BU88 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl22Q8BU88 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl22Q8BU88 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mrpl22Q8BU88 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl22Q8BU88 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl22Q8BU88 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl22Q8BU88 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mrpl22Q8BU88 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl22Q8BU88 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl22Q8BU88 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mrpl22Q8BU88 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl22Q8BU88 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mrpl22Q8BU88 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl22Q8BU88 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mrpl22Q8BU88 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl22Q8BU88 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl22Q8BU88 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Mrpl22Q8BU88 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl22Q8BU88 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl22Q8BU88 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl22Q8BU88 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl22Q8BU88 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mrpl22Q8BU88 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl22Q8BU88 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl22Q8BU88 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl22Q8BU88 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl22Q8BU88 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mrpl22Q8BU88 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mrpl22Q8BU88 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrpl22Q8BU88 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mrpl22Q8BU88 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl22Q8BU88 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl22Q8BU88 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mrpl22Q8BU88 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl22Q8BU88 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl22Q8BU88 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl22Q8BU88 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl22Q8BU88 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrpl22Q8BU88 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl22Q8BU88 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl22Q8BU88 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl22Q8BU88 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrpl22Q8BU88 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.3 ms