Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU40

Nlrp4a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4aQ8BU40 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp4aQ8BU40 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp4aQ8BU40 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp4aQ8BU40 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp4aQ8BU40 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp4aQ8BU40 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp4aQ8BU40 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp4aQ8BU40 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp4aQ8BU40 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp4aQ8BU40 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrp4aQ8BU40 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrp4aQ8BU40 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrp4aQ8BU40 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrp4aQ8BU40 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrp4aQ8BU40 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrp4aQ8BU40 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nlrp4aQ8BU40 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nlrp4aQ8BU40 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlrp4aQ8BU40 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nlrp4aQ8BU40 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlrp4aQ8BU40 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrp4aQ8BU40 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlrp4aQ8BU40 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp4aQ8BU40 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp4aQ8BU40 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp4aQ8BU40 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp4aQ8BU40 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp4aQ8BU40 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlrp4aQ8BU40 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrp4aQ8BU40 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrp4aQ8BU40 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrp4aQ8BU40 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlrp4aQ8BU40 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nlrp4aQ8BU40 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlrp4aQ8BU40 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp4aQ8BU40 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlrp4aQ8BU40 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrp4aQ8BU40 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlrp4aQ8BU40 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrp4aQ8BU40 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrp4aQ8BU40 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlrp4aQ8BU40 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp4aQ8BU40 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp4aQ8BU40 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp4aQ8BU40 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp4aQ8BU40 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp4aQ8BU40 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp4aQ8BU40 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlrp4aQ8BU40 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrp4aQ8BU40 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrp4aQ8BU40 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrp4aQ8BU40 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlrp4aQ8BU40 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrp4aQ8BU40 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlrp4aQ8BU40 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp4aQ8BU40 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp4aQ8BU40 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp4aQ8BU40 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp4aQ8BU40 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp4aQ8BU40 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nlrp4aQ8BU40 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrp4aQ8BU40 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrp4aQ8BU40 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nlrp4aQ8BU40 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nlrp4aQ8BU40 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrp4aQ8BU40 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp4aQ8BU40 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp4aQ8BU40 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp4aQ8BU40 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrp4aQ8BU40 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrp4aQ8BU40 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp4aQ8BU40 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp4aQ8BU40 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp4aQ8BU40 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp4aQ8BU40 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp4aQ8BU40 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp4aQ8BU40 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp4aQ8BU40 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp4aQ8BU40 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp4aQ8BU40 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp4aQ8BU40 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrp4aQ8BU40 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp4aQ8BU40 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp4aQ8BU40 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp4aQ8BU40 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp4aQ8BU40 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrp4aQ8BU40 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrp4aQ8BU40 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrp4aQ8BU40 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrp4aQ8BU40 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrp4aQ8BU40 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrp4aQ8BU40 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nlrp4aQ8BU40 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nlrp4aQ8BU40 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nlrp4aQ8BU40 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrp4aQ8BU40 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrp4aQ8BU40 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrp4aQ8BU40 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrp4aQ8BU40 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrp4aQ8BU40 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms