Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rps6kb1Q8BSK8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rps6kb1Q8BSK8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rps6kb1Q8BSK8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rps6kb1Q8BSK8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rps6kb1Q8BSK8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rps6kb1Q8BSK8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rps6kb1Q8BSK8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rps6kb1Q8BSK8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rps6kb1Q8BSK8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rps6kb1Q8BSK8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rps6kb1Q8BSK8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rps6kb1Q8BSK8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rps6kb1Q8BSK8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rps6kb1Q8BSK8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rps6kb1Q8BSK8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rps6kb1Q8BSK8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rps6kb1Q8BSK8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rps6kb1Q8BSK8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rps6kb1Q8BSK8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Rps6kb1Q8BSK8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Rps6kb1Q8BSK8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rps6kb1Q8BSK8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rps6kb1Q8BSK8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rps6kb1Q8BSK8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rps6kb1Q8BSK8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rps6kb1Q8BSK8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rps6kb1Q8BSK8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rps6kb1Q8BSK8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rps6kb1Q8BSK8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rps6kb1Q8BSK8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rps6kb1Q8BSK8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rps6kb1Q8BSK8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rps6kb1Q8BSK8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rps6kb1Q8BSK8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rps6kb1Q8BSK8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rps6kb1Q8BSK8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rps6kb1Q8BSK8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rps6kb1Q8BSK8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rps6kb1Q8BSK8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rps6kb1Q8BSK8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rps6kb1Q8BSK8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rps6kb1Q8BSK8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rps6kb1Q8BSK8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rps6kb1Q8BSK8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rps6kb1Q8BSK8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rps6kb1Q8BSK8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rps6kb1Q8BSK8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rps6kb1Q8BSK8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rps6kb1Q8BSK8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rps6kb1Q8BSK8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rps6kb1Q8BSK8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rps6kb1Q8BSK8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rps6kb1Q8BSK8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rps6kb1Q8BSK8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rps6kb1Q8BSK8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rps6kb1Q8BSK8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rps6kb1Q8BSK8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rps6kb1Q8BSK8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rps6kb1Q8BSK8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rps6kb1Q8BSK8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rps6kb1Q8BSK8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rps6kb1Q8BSK8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rps6kb1Q8BSK8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rps6kb1Q8BSK8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rps6kb1Q8BSK8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rps6kb1Q8BSK8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rps6kb1Q8BSK8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rps6kb1Q8BSK8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rps6kb1Q8BSK8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rps6kb1Q8BSK8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rps6kb1Q8BSK8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rps6kb1Q8BSK8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rps6kb1Q8BSK8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rps6kb1Q8BSK8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Rps6kb1Q8BSK8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rps6kb1Q8BSK8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rps6kb1Q8BSK8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rps6kb1Q8BSK8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rps6kb1Q8BSK8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rps6kb1Q8BSK8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rps6kb1Q8BSK8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rps6kb1Q8BSK8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rps6kb1Q8BSK8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rps6kb1Q8BSK8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rps6kb1Q8BSK8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rps6kb1Q8BSK8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rps6kb1Q8BSK8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rps6kb1Q8BSK8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rps6kb1Q8BSK8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rps6kb1Q8BSK8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rps6kb1Q8BSK8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rps6kb1Q8BSK8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Rps6kb1Q8BSK8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rps6kb1Q8BSK8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rps6kb1Q8BSK8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rps6kb1Q8BSK8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rps6kb1Q8BSK8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rps6kb1Q8BSK8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms