Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRM2

Gorab, RAB6-interacting golgin, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GorabQ8BRM2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GorabQ8BRM2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GorabQ8BRM2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GorabQ8BRM2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GorabQ8BRM2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GorabQ8BRM2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GorabQ8BRM2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
GorabQ8BRM2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GorabQ8BRM2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GorabQ8BRM2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GorabQ8BRM2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GorabQ8BRM2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GorabQ8BRM2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms