Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tspan12Q8BKT6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan12Q8BKT6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan12Q8BKT6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan12Q8BKT6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan12Q8BKT6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan12Q8BKT6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan12Q8BKT6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan12Q8BKT6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan12Q8BKT6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan12Q8BKT6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan12Q8BKT6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan12Q8BKT6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan12Q8BKT6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan12Q8BKT6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan12Q8BKT6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan12Q8BKT6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan12Q8BKT6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan12Q8BKT6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan12Q8BKT6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan12Q8BKT6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan12Q8BKT6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan12Q8BKT6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan12Q8BKT6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tspan12Q8BKT6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan12Q8BKT6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan12Q8BKT6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan12Q8BKT6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan12Q8BKT6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan12Q8BKT6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan12Q8BKT6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan12Q8BKT6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan12Q8BKT6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan12Q8BKT6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan12Q8BKT6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan12Q8BKT6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan12Q8BKT6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan12Q8BKT6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan12Q8BKT6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan12Q8BKT6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan12Q8BKT6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan12Q8BKT6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan12Q8BKT6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan12Q8BKT6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan12Q8BKT6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan12Q8BKT6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tspan12Q8BKT6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tspan12Q8BKT6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tspan12Q8BKT6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan12Q8BKT6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan12Q8BKT6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan12Q8BKT6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan12Q8BKT6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan12Q8BKT6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan12Q8BKT6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan12Q8BKT6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan12Q8BKT6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan12Q8BKT6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan12Q8BKT6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan12Q8BKT6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan12Q8BKT6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan12Q8BKT6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan12Q8BKT6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan12Q8BKT6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan12Q8BKT6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan12Q8BKT6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan12Q8BKT6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan12Q8BKT6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan12Q8BKT6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms