Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nop53Q8BK35 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nop53Q8BK35 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nop53Q8BK35 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nop53Q8BK35 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nop53Q8BK35 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nop53Q8BK35 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nop53Q8BK35 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nop53Q8BK35 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nop53Q8BK35 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nop53Q8BK35 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nop53Q8BK35 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Nop53Q8BK35 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nop53Q8BK35 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nop53Q8BK35 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nop53Q8BK35 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nop53Q8BK35 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nop53Q8BK35 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nop53Q8BK35 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nop53Q8BK35 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nop53Q8BK35 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nop53Q8BK35 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nop53Q8BK35 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nop53Q8BK35 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nop53Q8BK35 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nop53Q8BK35 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nop53Q8BK35 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nop53Q8BK35 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nop53Q8BK35 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nop53Q8BK35 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nop53Q8BK35 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nop53Q8BK35 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nop53Q8BK35 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nop53Q8BK35 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nop53Q8BK35 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nop53Q8BK35 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nop53Q8BK35 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nop53Q8BK35 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nop53Q8BK35 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nop53Q8BK35 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nop53Q8BK35 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nop53Q8BK35 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nop53Q8BK35 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nop53Q8BK35 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nop53Q8BK35 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nop53Q8BK35 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nop53Q8BK35 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nop53Q8BK35 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nop53Q8BK35 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nop53Q8BK35 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop53Q8BK35 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop53Q8BK35 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop53Q8BK35 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nop53Q8BK35 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nop53Q8BK35 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nop53Q8BK35 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nop53Q8BK35 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nop53Q8BK35 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nop53Q8BK35 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nop53Q8BK35 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nop53Q8BK35 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms