Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmco3Q8BH01 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmco3Q8BH01 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmco3Q8BH01 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmco3Q8BH01 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmco3Q8BH01 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmco3Q8BH01 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmco3Q8BH01 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmco3Q8BH01 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmco3Q8BH01 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmco3Q8BH01 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmco3Q8BH01 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmco3Q8BH01 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmco3Q8BH01 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmco3Q8BH01 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmco3Q8BH01 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmco3Q8BH01 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmco3Q8BH01 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmco3Q8BH01 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmco3Q8BH01 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmco3Q8BH01 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmco3Q8BH01 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmco3Q8BH01 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmco3Q8BH01 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmco3Q8BH01 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmco3Q8BH01 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tmco3Q8BH01 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmco3Q8BH01 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmco3Q8BH01 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmco3Q8BH01 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmco3Q8BH01 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmco3Q8BH01 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmco3Q8BH01 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmco3Q8BH01 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmco3Q8BH01 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmco3Q8BH01 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmco3Q8BH01 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmco3Q8BH01 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmco3Q8BH01 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmco3Q8BH01 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmco3Q8BH01 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmco3Q8BH01 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmco3Q8BH01 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmco3Q8BH01 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmco3Q8BH01 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmco3Q8BH01 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmco3Q8BH01 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmco3Q8BH01 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmco3Q8BH01 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmco3Q8BH01 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmco3Q8BH01 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmco3Q8BH01 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmco3Q8BH01 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmco3Q8BH01 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmco3Q8BH01 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmco3Q8BH01 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmco3Q8BH01 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmco3Q8BH01 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmco3Q8BH01 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmco3Q8BH01 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmco3Q8BH01 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmco3Q8BH01 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmco3Q8BH01 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmco3Q8BH01 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmco3Q8BH01 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmco3Q8BH01 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmco3Q8BH01 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmco3Q8BH01 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tmco3Q8BH01 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmco3Q8BH01 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmco3Q8BH01 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmco3Q8BH01 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmco3Q8BH01 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmco3Q8BH01 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmco3Q8BH01 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmco3Q8BH01 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmco3Q8BH01 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmco3Q8BH01 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmco3Q8BH01 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmco3Q8BH01 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmco3Q8BH01 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmco3Q8BH01 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmco3Q8BH01 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmco3Q8BH01 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmco3Q8BH01 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmco3Q8BH01 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmco3Q8BH01 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmco3Q8BH01 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmco3Q8BH01 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmco3Q8BH01 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmco3Q8BH01 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmco3Q8BH01 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmco3Q8BH01 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmco3Q8BH01 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmco3Q8BH01 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmco3Q8BH01 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmco3Q8BH01 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmco3Q8BH01 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmco3Q8BH01 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmco3Q8BH01 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms