Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe23Q8BGW3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe23Q8BGW3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhe23Q8BGW3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhe23Q8BGW3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhe23Q8BGW3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhe23Q8BGW3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhe23Q8BGW3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhe23Q8BGW3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhe23Q8BGW3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhe23Q8BGW3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhe23Q8BGW3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhe23Q8BGW3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhe23Q8BGW3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhe23Q8BGW3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe23Q8BGW3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe23Q8BGW3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe23Q8BGW3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe23Q8BGW3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe23Q8BGW3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlhe23Q8BGW3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlhe23Q8BGW3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlhe23Q8BGW3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlhe23Q8BGW3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhe23Q8BGW3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhe23Q8BGW3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhe23Q8BGW3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhe23Q8BGW3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlhe23Q8BGW3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlhe23Q8BGW3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlhe23Q8BGW3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhe23Q8BGW3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhe23Q8BGW3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhe23Q8BGW3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhe23Q8BGW3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhe23Q8BGW3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhe23Q8BGW3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhe23Q8BGW3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhe23Q8BGW3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhe23Q8BGW3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhe23Q8BGW3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhe23Q8BGW3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhe23Q8BGW3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhe23Q8BGW3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhe23Q8BGW3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Bhlhe23Q8BGW3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Bhlhe23Q8BGW3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Bhlhe23Q8BGW3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhe23Q8BGW3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhe23Q8BGW3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhe23Q8BGW3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhe23Q8BGW3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhe23Q8BGW3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhe23Q8BGW3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhe23Q8BGW3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Bhlhe23Q8BGW3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bhlhe23Q8BGW3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Bhlhe23Q8BGW3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhe23Q8BGW3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhe23Q8BGW3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhe23Q8BGW3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Bhlhe23Q8BGW3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlhe23Q8BGW3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlhe23Q8BGW3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlhe23Q8BGW3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Bhlhe23Q8BGW3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Bhlhe23Q8BGW3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms