Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRPF39Q86UA1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF39Q86UA1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF39Q86UA1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF39Q86UA1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRPF39Q86UA1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PRPF39Q86UA1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF39Q86UA1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF39Q86UA1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF39Q86UA1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRPF39Q86UA1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF39Q86UA1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF39Q86UA1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRPF39Q86UA1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF39Q86UA1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRPF39Q86UA1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF39Q86UA1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRPF39Q86UA1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF39Q86UA1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF39Q86UA1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF39Q86UA1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRPF39Q86UA1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRPF39Q86UA1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF39Q86UA1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF39Q86UA1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRPF39Q86UA1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF39Q86UA1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF39Q86UA1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF39Q86UA1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF39Q86UA1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF39Q86UA1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PRPF39Q86UA1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF39Q86UA1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF39Q86UA1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRPF39Q86UA1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF39Q86UA1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF39Q86UA1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF39Q86UA1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF39Q86UA1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRPF39Q86UA1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF39Q86UA1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF39Q86UA1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF39Q86UA1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRPF39Q86UA1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF39Q86UA1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF39Q86UA1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF39Q86UA1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF39Q86UA1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRPF39Q86UA1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF39Q86UA1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF39Q86UA1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF39Q86UA1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF39Q86UA1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF39Q86UA1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRPF39Q86UA1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF39Q86UA1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF39Q86UA1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF39Q86UA1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF39Q86UA1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF39Q86UA1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF39Q86UA1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF39Q86UA1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF39Q86UA1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF39Q86UA1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF39Q86UA1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms