Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc50Q810U5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc50Q810U5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc50Q810U5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc50Q810U5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc50Q810U5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc50Q810U5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc50Q810U5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc50Q810U5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc50Q810U5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc50Q810U5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc50Q810U5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc50Q810U5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc50Q810U5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc50Q810U5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc50Q810U5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc50Q810U5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc50Q810U5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc50Q810U5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc50Q810U5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc50Q810U5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc50Q810U5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc50Q810U5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc50Q810U5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc50Q810U5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc50Q810U5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc50Q810U5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc50Q810U5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc50Q810U5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc50Q810U5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc50Q810U5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc50Q810U5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc50Q810U5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc50Q810U5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc50Q810U5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc50Q810U5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc50Q810U5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc50Q810U5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc50Q810U5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc50Q810U5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc50Q810U5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc50Q810U5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc50Q810U5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc50Q810U5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc50Q810U5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc50Q810U5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc50Q810U5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc50Q810U5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc50Q810U5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc50Q810U5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc50Q810U5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc50Q810U5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc50Q810U5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc50Q810U5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc50Q810U5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc50Q810U5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc50Q810U5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc50Q810U5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc50Q810U5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc50Q810U5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc50Q810U5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc50Q810U5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc50Q810U5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc50Q810U5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc50Q810U5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc50Q810U5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc50Q810U5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc50Q810U5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc50Q810U5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc50Q810U5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc50Q810U5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc50Q810U5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms