Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tmem39bQ810L4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tmem39bQ810L4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tmem39bQ810L4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tmem39bQ810L4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tmem39bQ810L4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tmem39bQ810L4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tmem39bQ810L4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tmem39bQ810L4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Tmem39bQ810L4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tmem39bQ810L4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tmem39bQ810L4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tmem39bQ810L4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tmem39bQ810L4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tmem39bQ810L4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Tmem39bQ810L4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tmem39bQ810L4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tmem39bQ810L4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tmem39bQ810L4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tmem39bQ810L4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tmem39bQ810L4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tmem39bQ810L4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tmem39bQ810L4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tmem39bQ810L4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tmem39bQ810L4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tmem39bQ810L4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tmem39bQ810L4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tmem39bQ810L4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tmem39bQ810L4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Tmem39bQ810L4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tmem39bQ810L4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tmem39bQ810L4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tmem39bQ810L4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Tmem39bQ810L4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tmem39bQ810L4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tmem39bQ810L4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tmem39bQ810L4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tmem39bQ810L4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Tmem39bQ810L4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tmem39bQ810L4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tmem39bQ810L4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tmem39bQ810L4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tmem39bQ810L4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Tmem39bQ810L4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tmem39bQ810L4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tmem39bQ810L4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tmem39bQ810L4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmem39bQ810L4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmem39bQ810L4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmem39bQ810L4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmem39bQ810L4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmem39bQ810L4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tmem39bQ810L4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tmem39bQ810L4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tmem39bQ810L4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tmem39bQ810L4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Tmem39bQ810L4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Tmem39bQ810L4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tmem39bQ810L4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tmem39bQ810L4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tmem39bQ810L4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tmem39bQ810L4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tmem39bQ810L4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tmem39bQ810L4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tmem39bQ810L4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tmem39bQ810L4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tmem39bQ810L4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tmem39bQ810L4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tmem39bQ810L4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tmem39bQ810L4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tmem39bQ810L4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tmem39bQ810L4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tmem39bQ810L4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tmem39bQ810L4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tmem39bQ810L4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tmem39bQ810L4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tmem39bQ810L4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmem39bQ810L4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmem39bQ810L4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmem39bQ810L4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmem39bQ810L4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmem39bQ810L4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmem39bQ810L4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmem39bQ810L4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tmem39bQ810L4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tmem39bQ810L4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tmem39bQ810L4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tmem39bQ810L4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tmem39bQ810L4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tmem39bQ810L4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tmem39bQ810L4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Tmem39bQ810L4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tmem39bQ810L4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tmem39bQ810L4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmem39bQ810L4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmem39bQ810L4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tmem39bQ810L4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmem39bQ810L4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmem39bQ810L4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tmem39bQ810L4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms