Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Amigo1Q80ZD8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amigo1Q80ZD8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amigo1Q80ZD8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amigo1Q80ZD8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amigo1Q80ZD8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amigo1Q80ZD8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Amigo1Q80ZD8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Amigo1Q80ZD8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Amigo1Q80ZD8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Amigo1Q80ZD8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Amigo1Q80ZD8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Amigo1Q80ZD8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Amigo1Q80ZD8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Amigo1Q80ZD8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Amigo1Q80ZD8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Amigo1Q80ZD8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Amigo1Q80ZD8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Amigo1Q80ZD8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Amigo1Q80ZD8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Amigo1Q80ZD8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Amigo1Q80ZD8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Amigo1Q80ZD8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Amigo1Q80ZD8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Amigo1Q80ZD8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Amigo1Q80ZD8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Amigo1Q80ZD8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Amigo1Q80ZD8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Amigo1Q80ZD8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Amigo1Q80ZD8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Amigo1Q80ZD8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Amigo1Q80ZD8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Amigo1Q80ZD8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Amigo1Q80ZD8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Amigo1Q80ZD8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Amigo1Q80ZD8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Amigo1Q80ZD8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Amigo1Q80ZD8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Amigo1Q80ZD8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Amigo1Q80ZD8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Amigo1Q80ZD8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Amigo1Q80ZD8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Amigo1Q80ZD8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Amigo1Q80ZD8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Amigo1Q80ZD8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Amigo1Q80ZD8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Amigo1Q80ZD8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Amigo1Q80ZD8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Amigo1Q80ZD8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Amigo1Q80ZD8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Amigo1Q80ZD8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Amigo1Q80ZD8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Amigo1Q80ZD8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Amigo1Q80ZD8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Amigo1Q80ZD8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Amigo1Q80ZD8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Amigo1Q80ZD8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Amigo1Q80ZD8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Amigo1Q80ZD8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Amigo1Q80ZD8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Amigo1Q80ZD8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Amigo1Q80ZD8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Amigo1Q80ZD8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Amigo1Q80ZD8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Amigo1Q80ZD8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Amigo1Q80ZD8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Amigo1Q80ZD8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Amigo1Q80ZD8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Amigo1Q80ZD8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Amigo1Q80ZD8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Amigo1Q80ZD8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Amigo1Q80ZD8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Amigo1Q80ZD8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Amigo1Q80ZD8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Amigo1Q80ZD8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Amigo1Q80ZD8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Amigo1Q80ZD8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Amigo1Q80ZD8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Amigo1Q80ZD8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Amigo1Q80ZD8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Amigo1Q80ZD8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Amigo1Q80ZD8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Amigo1Q80ZD8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Amigo1Q80ZD8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Amigo1Q80ZD8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Amigo1Q80ZD8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Amigo1Q80ZD8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Amigo1Q80ZD8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Amigo1Q80ZD8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Amigo1Q80ZD8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Amigo1Q80ZD8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Amigo1Q80ZD8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Amigo1Q80ZD8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Amigo1Q80ZD8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Amigo1Q80ZD8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Amigo1Q80ZD8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Amigo1Q80ZD8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Amigo1Q80ZD8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Amigo1Q80ZD8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Amigo1Q80ZD8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169 ms