Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nrde2Q80XC6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrde2Q80XC6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrde2Q80XC6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrde2Q80XC6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrde2Q80XC6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrde2Q80XC6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nrde2Q80XC6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrde2Q80XC6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrde2Q80XC6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrde2Q80XC6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrde2Q80XC6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrde2Q80XC6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrde2Q80XC6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrde2Q80XC6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrde2Q80XC6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrde2Q80XC6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrde2Q80XC6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrde2Q80XC6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrde2Q80XC6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrde2Q80XC6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrde2Q80XC6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrde2Q80XC6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrde2Q80XC6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrde2Q80XC6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrde2Q80XC6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrde2Q80XC6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nrde2Q80XC6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrde2Q80XC6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrde2Q80XC6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrde2Q80XC6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nrde2Q80XC6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrde2Q80XC6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrde2Q80XC6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrde2Q80XC6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrde2Q80XC6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrde2Q80XC6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrde2Q80XC6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrde2Q80XC6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nrde2Q80XC6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nrde2Q80XC6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nrde2Q80XC6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nrde2Q80XC6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrde2Q80XC6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nrde2Q80XC6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nrde2Q80XC6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nrde2Q80XC6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nrde2Q80XC6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nrde2Q80XC6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nrde2Q80XC6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrde2Q80XC6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrde2Q80XC6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrde2Q80XC6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nrde2Q80XC6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nrde2Q80XC6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nrde2Q80XC6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nrde2Q80XC6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nrde2Q80XC6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nrde2Q80XC6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nrde2Q80XC6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nrde2Q80XC6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nrde2Q80XC6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nrde2Q80XC6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nrde2Q80XC6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nrde2Q80XC6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nrde2Q80XC6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nrde2Q80XC6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nrde2Q80XC6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nrde2Q80XC6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nrde2Q80XC6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nrde2Q80XC6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nrde2Q80XC6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nrde2Q80XC6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms