Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Otop3Q80UF9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Otop3Q80UF9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Otop3Q80UF9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Otop3Q80UF9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Otop3Q80UF9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Otop3Q80UF9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Otop3Q80UF9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Otop3Q80UF9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Otop3Q80UF9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Otop3Q80UF9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Otop3Q80UF9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Otop3Q80UF9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Otop3Q80UF9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Otop3Q80UF9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Otop3Q80UF9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Otop3Q80UF9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Otop3Q80UF9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Otop3Q80UF9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Otop3Q80UF9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Otop3Q80UF9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Otop3Q80UF9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Otop3Q80UF9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Otop3Q80UF9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Otop3Q80UF9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Otop3Q80UF9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Otop3Q80UF9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Otop3Q80UF9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Otop3Q80UF9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Otop3Q80UF9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Otop3Q80UF9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Otop3Q80UF9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Otop3Q80UF9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Otop3Q80UF9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Otop3Q80UF9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Otop3Q80UF9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Otop3Q80UF9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Otop3Q80UF9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Otop3Q80UF9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Otop3Q80UF9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Otop3Q80UF9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Otop3Q80UF9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Otop3Q80UF9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Otop3Q80UF9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Otop3Q80UF9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Otop3Q80UF9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Otop3Q80UF9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Otop3Q80UF9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Otop3Q80UF9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Otop3Q80UF9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Otop3Q80UF9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Otop3Q80UF9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Otop3Q80UF9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Otop3Q80UF9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Otop3Q80UF9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Otop3Q80UF9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Otop3Q80UF9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Otop3Q80UF9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Otop3Q80UF9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Otop3Q80UF9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Otop3Q80UF9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Otop3Q80UF9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Otop3Q80UF9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Otop3Q80UF9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Otop3Q80UF9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Otop3Q80UF9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Otop3Q80UF9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Otop3Q80UF9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Otop3Q80UF9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Otop3Q80UF9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Otop3Q80UF9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Otop3Q80UF9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Otop3Q80UF9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Otop3Q80UF9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Otop3Q80UF9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms