Protein–RNA interactions for Protein: Q80U58

Pum2, Pumilio homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum2Q80U58 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pum2Q80U58 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pum2Q80U58 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pum2Q80U58 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pum2Q80U58 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pum2Q80U58 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pum2Q80U58 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pum2Q80U58 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pum2Q80U58 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pum2Q80U58 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pum2Q80U58 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pum2Q80U58 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pum2Q80U58 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pum2Q80U58 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pum2Q80U58 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pum2Q80U58 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pum2Q80U58 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pum2Q80U58 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pum2Q80U58 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pum2Q80U58 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pum2Q80U58 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pum2Q80U58 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pum2Q80U58 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pum2Q80U58 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pum2Q80U58 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pum2Q80U58 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pum2Q80U58 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pum2Q80U58 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pum2Q80U58 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pum2Q80U58 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pum2Q80U58 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pum2Q80U58 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pum2Q80U58 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pum2Q80U58 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pum2Q80U58 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pum2Q80U58 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pum2Q80U58 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pum2Q80U58 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pum2Q80U58 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pum2Q80U58 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pum2Q80U58 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pum2Q80U58 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pum2Q80U58 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pum2Q80U58 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pum2Q80U58 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pum2Q80U58 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pum2Q80U58 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pum2Q80U58 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pum2Q80U58 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pum2Q80U58 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pum2Q80U58 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pum2Q80U58 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pum2Q80U58 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pum2Q80U58 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pum2Q80U58 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pum2Q80U58 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pum2Q80U58 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pum2Q80U58 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pum2Q80U58 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pum2Q80U58 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pum2Q80U58 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pum2Q80U58 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pum2Q80U58 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pum2Q80U58 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pum2Q80U58 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pum2Q80U58 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pum2Q80U58 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pum2Q80U58 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pum2Q80U58 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pum2Q80U58 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pum2Q80U58 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pum2Q80U58 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms