Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec18aQ7TSQ1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Clec18aQ7TSQ1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec18aQ7TSQ1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Clec18aQ7TSQ1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clec18aQ7TSQ1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Clec18aQ7TSQ1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clec18aQ7TSQ1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec18aQ7TSQ1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec18aQ7TSQ1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec18aQ7TSQ1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec18aQ7TSQ1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clec18aQ7TSQ1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clec18aQ7TSQ1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clec18aQ7TSQ1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clec18aQ7TSQ1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Clec18aQ7TSQ1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clec18aQ7TSQ1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clec18aQ7TSQ1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clec18aQ7TSQ1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec18aQ7TSQ1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec18aQ7TSQ1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec18aQ7TSQ1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec18aQ7TSQ1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clec18aQ7TSQ1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec18aQ7TSQ1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clec18aQ7TSQ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec18aQ7TSQ1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec18aQ7TSQ1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clec18aQ7TSQ1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clec18aQ7TSQ1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clec18aQ7TSQ1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clec18aQ7TSQ1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clec18aQ7TSQ1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clec18aQ7TSQ1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec18aQ7TSQ1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec18aQ7TSQ1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec18aQ7TSQ1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clec18aQ7TSQ1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clec18aQ7TSQ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clec18aQ7TSQ1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clec18aQ7TSQ1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clec18aQ7TSQ1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clec18aQ7TSQ1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clec18aQ7TSQ1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clec18aQ7TSQ1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clec18aQ7TSQ1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clec18aQ7TSQ1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clec18aQ7TSQ1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clec18aQ7TSQ1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clec18aQ7TSQ1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec18aQ7TSQ1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec18aQ7TSQ1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec18aQ7TSQ1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec18aQ7TSQ1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clec18aQ7TSQ1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clec18aQ7TSQ1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clec18aQ7TSQ1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clec18aQ7TSQ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clec18aQ7TSQ1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec18aQ7TSQ1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec18aQ7TSQ1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec18aQ7TSQ1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec18aQ7TSQ1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clec18aQ7TSQ1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clec18aQ7TSQ1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clec18aQ7TSQ1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clec18aQ7TSQ1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clec18aQ7TSQ1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clec18aQ7TSQ1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clec18aQ7TSQ1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec18aQ7TSQ1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec18aQ7TSQ1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec18aQ7TSQ1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clec18aQ7TSQ1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clec18aQ7TSQ1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clec18aQ7TSQ1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clec18aQ7TSQ1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clec18aQ7TSQ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clec18aQ7TSQ1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec18aQ7TSQ1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec18aQ7TSQ1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec18aQ7TSQ1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clec18aQ7TSQ1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec18aQ7TSQ1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec18aQ7TSQ1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec18aQ7TSQ1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec18aQ7TSQ1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec18aQ7TSQ1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec18aQ7TSQ1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clec18aQ7TSQ1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clec18aQ7TSQ1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clec18aQ7TSQ1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clec18aQ7TSQ1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clec18aQ7TSQ1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clec18aQ7TSQ1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clec18aQ7TSQ1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms