Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ69

Tmc3, Transmembrane channel-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc3Q7TQ69 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Tmc3Q7TQ69 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmc3Q7TQ69 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmc3Q7TQ69 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmc3Q7TQ69 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmc3Q7TQ69 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmc3Q7TQ69 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmc3Q7TQ69 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmc3Q7TQ69 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmc3Q7TQ69 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmc3Q7TQ69 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmc3Q7TQ69 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmc3Q7TQ69 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Tmc3Q7TQ69 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmc3Q7TQ69 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmc3Q7TQ69 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmc3Q7TQ69 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmc3Q7TQ69 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmc3Q7TQ69 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmc3Q7TQ69 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmc3Q7TQ69 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmc3Q7TQ69 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmc3Q7TQ69 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmc3Q7TQ69 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmc3Q7TQ69 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmc3Q7TQ69 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmc3Q7TQ69 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmc3Q7TQ69 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmc3Q7TQ69 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmc3Q7TQ69 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmc3Q7TQ69 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmc3Q7TQ69 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmc3Q7TQ69 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tmc3Q7TQ69 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tmc3Q7TQ69 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmc3Q7TQ69 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tmc3Q7TQ69 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmc3Q7TQ69 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmc3Q7TQ69 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmc3Q7TQ69 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmc3Q7TQ69 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmc3Q7TQ69 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmc3Q7TQ69 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmc3Q7TQ69 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmc3Q7TQ69 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmc3Q7TQ69 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmc3Q7TQ69 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmc3Q7TQ69 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmc3Q7TQ69 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmc3Q7TQ69 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmc3Q7TQ69 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tmc3Q7TQ69 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tmc3Q7TQ69 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tmc3Q7TQ69 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmc3Q7TQ69 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmc3Q7TQ69 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmc3Q7TQ69 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmc3Q7TQ69 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmc3Q7TQ69 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tmc3Q7TQ69 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmc3Q7TQ69 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmc3Q7TQ69 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmc3Q7TQ69 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmc3Q7TQ69 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmc3Q7TQ69 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmc3Q7TQ69 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmc3Q7TQ69 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmc3Q7TQ69 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmc3Q7TQ69 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmc3Q7TQ69 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmc3Q7TQ69 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmc3Q7TQ69 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmc3Q7TQ69 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmc3Q7TQ69 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmc3Q7TQ69 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmc3Q7TQ69 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmc3Q7TQ69 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmc3Q7TQ69 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmc3Q7TQ69 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmc3Q7TQ69 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmc3Q7TQ69 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmc3Q7TQ69 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmc3Q7TQ69 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmc3Q7TQ69 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmc3Q7TQ69 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmc3Q7TQ69 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmc3Q7TQ69 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmc3Q7TQ69 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmc3Q7TQ69 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmc3Q7TQ69 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmc3Q7TQ69 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmc3Q7TQ69 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmc3Q7TQ69 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmc3Q7TQ69 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmc3Q7TQ69 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmc3Q7TQ69 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmc3Q7TQ69 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmc3Q7TQ69 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmc3Q7TQ69 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmc3Q7TQ69 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms