Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPG0

1700010I14Rik, GI:13385330, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700010I14RikQ7TPG0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
1700010I14RikQ7TPG0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
1700010I14RikQ7TPG0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
1700010I14RikQ7TPG0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
1700010I14RikQ7TPG0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
1700010I14RikQ7TPG0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
1700010I14RikQ7TPG0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
1700010I14RikQ7TPG0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
1700010I14RikQ7TPG0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
1700010I14RikQ7TPG0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
1700010I14RikQ7TPG0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
1700010I14RikQ7TPG0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
1700010I14RikQ7TPG0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
1700010I14RikQ7TPG0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
1700010I14RikQ7TPG0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
1700010I14RikQ7TPG0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
1700010I14RikQ7TPG0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
1700010I14RikQ7TPG0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
1700010I14RikQ7TPG0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
1700010I14RikQ7TPG0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
1700010I14RikQ7TPG0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
1700010I14RikQ7TPG0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
1700010I14RikQ7TPG0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
1700010I14RikQ7TPG0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
1700010I14RikQ7TPG0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
1700010I14RikQ7TPG0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
1700010I14RikQ7TPG0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
1700010I14RikQ7TPG0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
1700010I14RikQ7TPG0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
1700010I14RikQ7TPG0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
1700010I14RikQ7TPG0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
1700010I14RikQ7TPG0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
1700010I14RikQ7TPG0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
1700010I14RikQ7TPG0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
1700010I14RikQ7TPG0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
1700010I14RikQ7TPG0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
1700010I14RikQ7TPG0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
1700010I14RikQ7TPG0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
1700010I14RikQ7TPG0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
1700010I14RikQ7TPG0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
1700010I14RikQ7TPG0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
1700010I14RikQ7TPG0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
1700010I14RikQ7TPG0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
1700010I14RikQ7TPG0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
1700010I14RikQ7TPG0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
1700010I14RikQ7TPG0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
1700010I14RikQ7TPG0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
1700010I14RikQ7TPG0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
1700010I14RikQ7TPG0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
1700010I14RikQ7TPG0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
1700010I14RikQ7TPG0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
1700010I14RikQ7TPG0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
1700010I14RikQ7TPG0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
1700010I14RikQ7TPG0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
1700010I14RikQ7TPG0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
1700010I14RikQ7TPG0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
1700010I14RikQ7TPG0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
1700010I14RikQ7TPG0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
1700010I14RikQ7TPG0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
1700010I14RikQ7TPG0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
1700010I14RikQ7TPG0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
1700010I14RikQ7TPG0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
1700010I14RikQ7TPG0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
1700010I14RikQ7TPG0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
1700010I14RikQ7TPG0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
1700010I14RikQ7TPG0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
1700010I14RikQ7TPG0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
1700010I14RikQ7TPG0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
1700010I14RikQ7TPG0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
1700010I14RikQ7TPG0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
1700010I14RikQ7TPG0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700010I14RikQ7TPG0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700010I14RikQ7TPG0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
1700010I14RikQ7TPG0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700010I14RikQ7TPG0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700010I14RikQ7TPG0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
1700010I14RikQ7TPG0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700010I14RikQ7TPG0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700010I14RikQ7TPG0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700010I14RikQ7TPG0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
1700010I14RikQ7TPG0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
1700010I14RikQ7TPG0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
1700010I14RikQ7TPG0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
1700010I14RikQ7TPG0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.57■■■□□ 2
1700010I14RikQ7TPG0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
1700010I14RikQ7TPG0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
1700010I14RikQ7TPG0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
1700010I14RikQ7TPG0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.56■■■□□ 2
1700010I14RikQ7TPG0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
1700010I14RikQ7TPG0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
1700010I14RikQ7TPG0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
1700010I14RikQ7TPG0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
1700010I14RikQ7TPG0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
1700010I14RikQ7TPG0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
1700010I14RikQ7TPG0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
1700010I14RikQ7TPG0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
1700010I14RikQ7TPG0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
1700010I14RikQ7TPG0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
1700010I14RikQ7TPG0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
1700010I14RikQ7TPG0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms