Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmc8Q7TN58 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmc8Q7TN58 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmc8Q7TN58 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmc8Q7TN58 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmc8Q7TN58 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmc8Q7TN58 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmc8Q7TN58 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmc8Q7TN58 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmc8Q7TN58 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmc8Q7TN58 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmc8Q7TN58 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmc8Q7TN58 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmc8Q7TN58 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tmc8Q7TN58 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmc8Q7TN58 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmc8Q7TN58 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmc8Q7TN58 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmc8Q7TN58 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmc8Q7TN58 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmc8Q7TN58 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmc8Q7TN58 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmc8Q7TN58 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmc8Q7TN58 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmc8Q7TN58 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmc8Q7TN58 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmc8Q7TN58 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmc8Q7TN58 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmc8Q7TN58 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmc8Q7TN58 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmc8Q7TN58 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmc8Q7TN58 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmc8Q7TN58 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmc8Q7TN58 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmc8Q7TN58 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmc8Q7TN58 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmc8Q7TN58 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmc8Q7TN58 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmc8Q7TN58 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmc8Q7TN58 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmc8Q7TN58 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Tmc8Q7TN58 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Tmc8Q7TN58 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmc8Q7TN58 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tmc8Q7TN58 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmc8Q7TN58 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmc8Q7TN58 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmc8Q7TN58 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmc8Q7TN58 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmc8Q7TN58 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmc8Q7TN58 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmc8Q7TN58 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmc8Q7TN58 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmc8Q7TN58 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmc8Q7TN58 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmc8Q7TN58 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmc8Q7TN58 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmc8Q7TN58 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmc8Q7TN58 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmc8Q7TN58 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmc8Q7TN58 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmc8Q7TN58 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmc8Q7TN58 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmc8Q7TN58 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmc8Q7TN58 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmc8Q7TN58 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmc8Q7TN58 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmc8Q7TN58 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmc8Q7TN58 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmc8Q7TN58 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmc8Q7TN58 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmc8Q7TN58 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmc8Q7TN58 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmc8Q7TN58 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmc8Q7TN58 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmc8Q7TN58 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmc8Q7TN58 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmc8Q7TN58 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmc8Q7TN58 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmc8Q7TN58 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmc8Q7TN58 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmc8Q7TN58 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmc8Q7TN58 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmc8Q7TN58 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmc8Q7TN58 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmc8Q7TN58 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmc8Q7TN58 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmc8Q7TN58 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmc8Q7TN58 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmc8Q7TN58 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmc8Q7TN58 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tmc8Q7TN58 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tmc8Q7TN58 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmc8Q7TN58 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmc8Q7TN58 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmc8Q7TN58 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmc8Q7TN58 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmc8Q7TN58 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmc8Q7TN58 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmc8Q7TN58 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms