Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU7

SCX, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCXQ7RTU7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCXQ7RTU7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SCXQ7RTU7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCXQ7RTU7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms