Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd3eapQ76KJ5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd3eapQ76KJ5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd3eapQ76KJ5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd3eapQ76KJ5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd3eapQ76KJ5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cd3eapQ76KJ5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd3eapQ76KJ5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd3eapQ76KJ5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd3eapQ76KJ5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd3eapQ76KJ5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cd3eapQ76KJ5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cd3eapQ76KJ5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cd3eapQ76KJ5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Cd3eapQ76KJ5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cd3eapQ76KJ5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd3eapQ76KJ5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd3eapQ76KJ5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd3eapQ76KJ5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd3eapQ76KJ5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd3eapQ76KJ5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd3eapQ76KJ5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd3eapQ76KJ5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd3eapQ76KJ5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd3eapQ76KJ5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd3eapQ76KJ5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd3eapQ76KJ5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd3eapQ76KJ5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd3eapQ76KJ5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cd3eapQ76KJ5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd3eapQ76KJ5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd3eapQ76KJ5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd3eapQ76KJ5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd3eapQ76KJ5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd3eapQ76KJ5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd3eapQ76KJ5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd3eapQ76KJ5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd3eapQ76KJ5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd3eapQ76KJ5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd3eapQ76KJ5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cd3eapQ76KJ5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd3eapQ76KJ5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd3eapQ76KJ5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd3eapQ76KJ5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd3eapQ76KJ5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd3eapQ76KJ5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd3eapQ76KJ5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd3eapQ76KJ5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd3eapQ76KJ5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd3eapQ76KJ5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd3eapQ76KJ5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd3eapQ76KJ5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd3eapQ76KJ5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd3eapQ76KJ5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd3eapQ76KJ5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd3eapQ76KJ5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd3eapQ76KJ5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd3eapQ76KJ5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd3eapQ76KJ5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd3eapQ76KJ5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd3eapQ76KJ5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd3eapQ76KJ5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd3eapQ76KJ5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd3eapQ76KJ5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd3eapQ76KJ5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd3eapQ76KJ5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd3eapQ76KJ5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd3eapQ76KJ5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd3eapQ76KJ5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd3eapQ76KJ5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd3eapQ76KJ5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd3eapQ76KJ5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd3eapQ76KJ5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd3eapQ76KJ5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd3eapQ76KJ5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd3eapQ76KJ5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd3eapQ76KJ5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd3eapQ76KJ5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd3eapQ76KJ5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd3eapQ76KJ5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd3eapQ76KJ5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd3eapQ76KJ5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd3eapQ76KJ5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd3eapQ76KJ5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd3eapQ76KJ5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd3eapQ76KJ5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd3eapQ76KJ5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd3eapQ76KJ5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd3eapQ76KJ5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd3eapQ76KJ5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd3eapQ76KJ5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd3eapQ76KJ5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd3eapQ76KJ5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd3eapQ76KJ5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd3eapQ76KJ5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd3eapQ76KJ5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd3eapQ76KJ5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd3eapQ76KJ5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd3eapQ76KJ5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd3eapQ76KJ5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms