Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sned1Q70E20 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sned1Q70E20 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sned1Q70E20 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sned1Q70E20 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sned1Q70E20 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Sned1Q70E20 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Sned1Q70E20 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sned1Q70E20 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sned1Q70E20 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sned1Q70E20 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sned1Q70E20 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sned1Q70E20 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sned1Q70E20 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sned1Q70E20 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sned1Q70E20 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sned1Q70E20 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sned1Q70E20 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sned1Q70E20 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Sned1Q70E20 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Sned1Q70E20 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Sned1Q70E20 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Sned1Q70E20 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sned1Q70E20 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sned1Q70E20 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Sned1Q70E20 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sned1Q70E20 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sned1Q70E20 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Sned1Q70E20 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sned1Q70E20 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sned1Q70E20 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Sned1Q70E20 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Sned1Q70E20 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Sned1Q70E20 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Sned1Q70E20 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sned1Q70E20 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Sned1Q70E20 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sned1Q70E20 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Sned1Q70E20 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sned1Q70E20 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sned1Q70E20 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Sned1Q70E20 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sned1Q70E20 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Sned1Q70E20 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sned1Q70E20 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sned1Q70E20 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Sned1Q70E20 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sned1Q70E20 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sned1Q70E20 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sned1Q70E20 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Sned1Q70E20 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sned1Q70E20 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sned1Q70E20 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sned1Q70E20 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sned1Q70E20 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sned1Q70E20 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Sned1Q70E20 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sned1Q70E20 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sned1Q70E20 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sned1Q70E20 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sned1Q70E20 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sned1Q70E20 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sned1Q70E20 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sned1Q70E20 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sned1Q70E20 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sned1Q70E20 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sned1Q70E20 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sned1Q70E20 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sned1Q70E20 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sned1Q70E20 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sned1Q70E20 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sned1Q70E20 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Sned1Q70E20 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sned1Q70E20 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sned1Q70E20 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sned1Q70E20 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sned1Q70E20 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Sned1Q70E20 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Sned1Q70E20 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sned1Q70E20 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Sned1Q70E20 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Sned1Q70E20 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Sned1Q70E20 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sned1Q70E20 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sned1Q70E20 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sned1Q70E20 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sned1Q70E20 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sned1Q70E20 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Sned1Q70E20 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sned1Q70E20 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sned1Q70E20 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Sned1Q70E20 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Sned1Q70E20 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sned1Q70E20 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sned1Q70E20 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Sned1Q70E20 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sned1Q70E20 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sned1Q70E20 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sned1Q70E20 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sned1Q70E20 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms