Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
USP31Q70CQ4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
USP31Q70CQ4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
USP31Q70CQ4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
USP31Q70CQ4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
USP31Q70CQ4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
USP31Q70CQ4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
USP31Q70CQ4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
USP31Q70CQ4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
USP31Q70CQ4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
USP31Q70CQ4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
USP31Q70CQ4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
USP31Q70CQ4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
USP31Q70CQ4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
USP31Q70CQ4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
USP31Q70CQ4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
USP31Q70CQ4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
USP31Q70CQ4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
USP31Q70CQ4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
USP31Q70CQ4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
USP31Q70CQ4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
USP31Q70CQ4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
USP31Q70CQ4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
USP31Q70CQ4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
USP31Q70CQ4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
USP31Q70CQ4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
USP31Q70CQ4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
USP31Q70CQ4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
USP31Q70CQ4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
USP31Q70CQ4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
USP31Q70CQ4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
USP31Q70CQ4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
USP31Q70CQ4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
USP31Q70CQ4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
USP31Q70CQ4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
USP31Q70CQ4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
USP31Q70CQ4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
USP31Q70CQ4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
USP31Q70CQ4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
USP31Q70CQ4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
USP31Q70CQ4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
USP31Q70CQ4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
USP31Q70CQ4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
USP31Q70CQ4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
USP31Q70CQ4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
USP31Q70CQ4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
USP31Q70CQ4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
USP31Q70CQ4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
USP31Q70CQ4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
USP31Q70CQ4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
USP31Q70CQ4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
USP31Q70CQ4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
USP31Q70CQ4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
USP31Q70CQ4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
USP31Q70CQ4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
USP31Q70CQ4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
USP31Q70CQ4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
USP31Q70CQ4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
USP31Q70CQ4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
USP31Q70CQ4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
USP31Q70CQ4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
USP31Q70CQ4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
USP31Q70CQ4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
USP31Q70CQ4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
USP31Q70CQ4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
USP31Q70CQ4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
USP31Q70CQ4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
USP31Q70CQ4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
USP31Q70CQ4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
USP31Q70CQ4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
USP31Q70CQ4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
USP31Q70CQ4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
USP31Q70CQ4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
USP31Q70CQ4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
USP31Q70CQ4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
USP31Q70CQ4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
USP31Q70CQ4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
USP31Q70CQ4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
USP31Q70CQ4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
USP31Q70CQ4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
USP31Q70CQ4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
USP31Q70CQ4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
USP31Q70CQ4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
USP31Q70CQ4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
USP31Q70CQ4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP31Q70CQ4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP31Q70CQ4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP31Q70CQ4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
USP31Q70CQ4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
USP31Q70CQ4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
USP31Q70CQ4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
USP31Q70CQ4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
USP31Q70CQ4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
USP31Q70CQ4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms