Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM136Q6ZRR5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMEM136Q6ZRR5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TMEM136Q6ZRR5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms