Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp34Q6ZQ93 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp34Q6ZQ93 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp34Q6ZQ93 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp34Q6ZQ93 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp34Q6ZQ93 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp34Q6ZQ93 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp34Q6ZQ93 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp34Q6ZQ93 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp34Q6ZQ93 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp34Q6ZQ93 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp34Q6ZQ93 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp34Q6ZQ93 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp34Q6ZQ93 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp34Q6ZQ93 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Usp34Q6ZQ93 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp34Q6ZQ93 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp34Q6ZQ93 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp34Q6ZQ93 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp34Q6ZQ93 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp34Q6ZQ93 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp34Q6ZQ93 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp34Q6ZQ93 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp34Q6ZQ93 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp34Q6ZQ93 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp34Q6ZQ93 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp34Q6ZQ93 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Usp34Q6ZQ93 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp34Q6ZQ93 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp34Q6ZQ93 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp34Q6ZQ93 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp34Q6ZQ93 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp34Q6ZQ93 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp34Q6ZQ93 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp34Q6ZQ93 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp34Q6ZQ93 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp34Q6ZQ93 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp34Q6ZQ93 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp34Q6ZQ93 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp34Q6ZQ93 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp34Q6ZQ93 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Usp34Q6ZQ93 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Usp34Q6ZQ93 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp34Q6ZQ93 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp34Q6ZQ93 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp34Q6ZQ93 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp34Q6ZQ93 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp34Q6ZQ93 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp34Q6ZQ93 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp34Q6ZQ93 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp34Q6ZQ93 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp34Q6ZQ93 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp34Q6ZQ93 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp34Q6ZQ93 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp34Q6ZQ93 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp34Q6ZQ93 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp34Q6ZQ93 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp34Q6ZQ93 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp34Q6ZQ93 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp34Q6ZQ93 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp34Q6ZQ93 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp34Q6ZQ93 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp34Q6ZQ93 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp34Q6ZQ93 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp34Q6ZQ93 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp34Q6ZQ93 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp34Q6ZQ93 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp34Q6ZQ93 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp34Q6ZQ93 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Usp34Q6ZQ93 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp34Q6ZQ93 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp34Q6ZQ93 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp34Q6ZQ93 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp34Q6ZQ93 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp34Q6ZQ93 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp34Q6ZQ93 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp34Q6ZQ93 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp34Q6ZQ93 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp34Q6ZQ93 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp34Q6ZQ93 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp34Q6ZQ93 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp34Q6ZQ93 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp34Q6ZQ93 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp34Q6ZQ93 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp34Q6ZQ93 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp34Q6ZQ93 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp34Q6ZQ93 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp34Q6ZQ93 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp34Q6ZQ93 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Usp34Q6ZQ93 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Usp34Q6ZQ93 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp34Q6ZQ93 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp34Q6ZQ93 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp34Q6ZQ93 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp34Q6ZQ93 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp34Q6ZQ93 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp34Q6ZQ93 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp34Q6ZQ93 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp34Q6ZQ93 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp34Q6ZQ93 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms