Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cnot1Q6ZQ08 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot1Q6ZQ08 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot1Q6ZQ08 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot1Q6ZQ08 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnot1Q6ZQ08 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnot1Q6ZQ08 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnot1Q6ZQ08 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnot1Q6ZQ08 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot1Q6ZQ08 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot1Q6ZQ08 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot1Q6ZQ08 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cnot1Q6ZQ08 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnot1Q6ZQ08 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cnot1Q6ZQ08 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnot1Q6ZQ08 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cnot1Q6ZQ08 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnot1Q6ZQ08 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnot1Q6ZQ08 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnot1Q6ZQ08 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnot1Q6ZQ08 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnot1Q6ZQ08 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot1Q6ZQ08 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot1Q6ZQ08 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot1Q6ZQ08 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot1Q6ZQ08 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnot1Q6ZQ08 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot1Q6ZQ08 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnot1Q6ZQ08 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot1Q6ZQ08 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot1Q6ZQ08 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cnot1Q6ZQ08 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot1Q6ZQ08 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot1Q6ZQ08 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot1Q6ZQ08 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot1Q6ZQ08 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot1Q6ZQ08 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot1Q6ZQ08 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot1Q6ZQ08 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot1Q6ZQ08 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot1Q6ZQ08 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot1Q6ZQ08 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot1Q6ZQ08 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot1Q6ZQ08 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnot1Q6ZQ08 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnot1Q6ZQ08 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnot1Q6ZQ08 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnot1Q6ZQ08 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnot1Q6ZQ08 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnot1Q6ZQ08 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnot1Q6ZQ08 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms