Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CCDC141Q6ZP82 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CCDC141Q6ZP82 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CCDC141Q6ZP82 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
CCDC141Q6ZP82 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CCDC141Q6ZP82 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
CCDC141Q6ZP82 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CCDC141Q6ZP82 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CCDC141Q6ZP82 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CCDC141Q6ZP82 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CCDC141Q6ZP82 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CCDC141Q6ZP82 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CCDC141Q6ZP82 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
CCDC141Q6ZP82 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CCDC141Q6ZP82 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CCDC141Q6ZP82 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CCDC141Q6ZP82 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CCDC141Q6ZP82 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
CCDC141Q6ZP82 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CCDC141Q6ZP82 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CCDC141Q6ZP82 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CCDC141Q6ZP82 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CCDC141Q6ZP82 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CCDC141Q6ZP82 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CCDC141Q6ZP82 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CCDC141Q6ZP82 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CCDC141Q6ZP82 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CCDC141Q6ZP82 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CCDC141Q6ZP82 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CCDC141Q6ZP82 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CCDC141Q6ZP82 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
CCDC141Q6ZP82 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CCDC141Q6ZP82 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CCDC141Q6ZP82 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CCDC141Q6ZP82 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CCDC141Q6ZP82 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CCDC141Q6ZP82 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CCDC141Q6ZP82 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
CCDC141Q6ZP82 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
CCDC141Q6ZP82 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CCDC141Q6ZP82 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
CCDC141Q6ZP82 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CCDC141Q6ZP82 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CCDC141Q6ZP82 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CCDC141Q6ZP82 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CCDC141Q6ZP82 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CCDC141Q6ZP82 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CCDC141Q6ZP82 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CCDC141Q6ZP82 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CCDC141Q6ZP82 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
CCDC141Q6ZP82 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
CCDC141Q6ZP82 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
CCDC141Q6ZP82 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CCDC141Q6ZP82 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CCDC141Q6ZP82 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CCDC141Q6ZP82 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CCDC141Q6ZP82 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CCDC141Q6ZP82 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
CCDC141Q6ZP82 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CCDC141Q6ZP82 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CCDC141Q6ZP82 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CCDC141Q6ZP82 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CCDC141Q6ZP82 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CCDC141Q6ZP82 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
CCDC141Q6ZP82 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CCDC141Q6ZP82 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CCDC141Q6ZP82 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CCDC141Q6ZP82 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CCDC141Q6ZP82 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
CCDC141Q6ZP82 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CCDC141Q6ZP82 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CCDC141Q6ZP82 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CCDC141Q6ZP82 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CCDC141Q6ZP82 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CCDC141Q6ZP82 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CCDC141Q6ZP82 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CCDC141Q6ZP82 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
CCDC141Q6ZP82 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
CCDC141Q6ZP82 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CCDC141Q6ZP82 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CCDC141Q6ZP82 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
CCDC141Q6ZP82 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CCDC141Q6ZP82 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CCDC141Q6ZP82 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CCDC141Q6ZP82 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC141Q6ZP82 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC141Q6ZP82 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC141Q6ZP82 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC141Q6ZP82 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC141Q6ZP82 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
CCDC141Q6ZP82 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CCDC141Q6ZP82 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
CCDC141Q6ZP82 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CCDC141Q6ZP82 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CCDC141Q6ZP82 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CCDC141Q6ZP82 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
CCDC141Q6ZP82 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CCDC141Q6ZP82 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
CCDC141Q6ZP82 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CCDC141Q6ZP82 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms