Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GBP6Q6ZN66 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GBP6Q6ZN66 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBP6Q6ZN66 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBP6Q6ZN66 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBP6Q6ZN66 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GBP6Q6ZN66 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GBP6Q6ZN66 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GBP6Q6ZN66 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GBP6Q6ZN66 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
GBP6Q6ZN66 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GBP6Q6ZN66 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GBP6Q6ZN66 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GBP6Q6ZN66 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GBP6Q6ZN66 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GBP6Q6ZN66 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GBP6Q6ZN66 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GBP6Q6ZN66 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
GBP6Q6ZN66 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GBP6Q6ZN66 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GBP6Q6ZN66 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GBP6Q6ZN66 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GBP6Q6ZN66 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GBP6Q6ZN66 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GBP6Q6ZN66 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GBP6Q6ZN66 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GBP6Q6ZN66 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
GBP6Q6ZN66 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
GBP6Q6ZN66 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GBP6Q6ZN66 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GBP6Q6ZN66 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GBP6Q6ZN66 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GBP6Q6ZN66 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GBP6Q6ZN66 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GBP6Q6ZN66 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GBP6Q6ZN66 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GBP6Q6ZN66 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GBP6Q6ZN66 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GBP6Q6ZN66 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GBP6Q6ZN66 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GBP6Q6ZN66 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GBP6Q6ZN66 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GBP6Q6ZN66 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GBP6Q6ZN66 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP6Q6ZN66 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP6Q6ZN66 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GBP6Q6ZN66 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GBP6Q6ZN66 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GBP6Q6ZN66 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GBP6Q6ZN66 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GBP6Q6ZN66 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GBP6Q6ZN66 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GBP6Q6ZN66 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GBP6Q6ZN66 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GBP6Q6ZN66 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GBP6Q6ZN66 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GBP6Q6ZN66 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GBP6Q6ZN66 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GBP6Q6ZN66 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GBP6Q6ZN66 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GBP6Q6ZN66 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GBP6Q6ZN66 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GBP6Q6ZN66 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GBP6Q6ZN66 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GBP6Q6ZN66 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GBP6Q6ZN66 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GBP6Q6ZN66 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GBP6Q6ZN66 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GBP6Q6ZN66 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GBP6Q6ZN66 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GBP6Q6ZN66 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GBP6Q6ZN66 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GBP6Q6ZN66 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GBP6Q6ZN66 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GBP6Q6ZN66 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GBP6Q6ZN66 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GBP6Q6ZN66 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GBP6Q6ZN66 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GBP6Q6ZN66 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GBP6Q6ZN66 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GBP6Q6ZN66 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GBP6Q6ZN66 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GBP6Q6ZN66 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GBP6Q6ZN66 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GBP6Q6ZN66 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GBP6Q6ZN66 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GBP6Q6ZN66 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GBP6Q6ZN66 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GBP6Q6ZN66 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GBP6Q6ZN66 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GBP6Q6ZN66 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GBP6Q6ZN66 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GBP6Q6ZN66 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GBP6Q6ZN66 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GBP6Q6ZN66 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GBP6Q6ZN66 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GBP6Q6ZN66 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms