Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN30

BNC2, Zinc finger protein basonuclin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2Q6ZN30 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BNC2Q6ZN30 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BNC2Q6ZN30 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BNC2Q6ZN30 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BNC2Q6ZN30 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BNC2Q6ZN30 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BNC2Q6ZN30 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BNC2Q6ZN30 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BNC2Q6ZN30 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BNC2Q6ZN30 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BNC2Q6ZN30 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BNC2Q6ZN30 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BNC2Q6ZN30 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BNC2Q6ZN30 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BNC2Q6ZN30 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BNC2Q6ZN30 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BNC2Q6ZN30 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BNC2Q6ZN30 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BNC2Q6ZN30 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNC2Q6ZN30 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNC2Q6ZN30 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNC2Q6ZN30 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNC2Q6ZN30 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BNC2Q6ZN30 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BNC2Q6ZN30 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BNC2Q6ZN30 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BNC2Q6ZN30 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BNC2Q6ZN30 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BNC2Q6ZN30 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BNC2Q6ZN30 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BNC2Q6ZN30 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BNC2Q6ZN30 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BNC2Q6ZN30 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BNC2Q6ZN30 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BNC2Q6ZN30 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BNC2Q6ZN30 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BNC2Q6ZN30 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BNC2Q6ZN30 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BNC2Q6ZN30 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNC2Q6ZN30 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNC2Q6ZN30 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNC2Q6ZN30 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BNC2Q6ZN30 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BNC2Q6ZN30 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BNC2Q6ZN30 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BNC2Q6ZN30 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BNC2Q6ZN30 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BNC2Q6ZN30 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BNC2Q6ZN30 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BNC2Q6ZN30 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BNC2Q6ZN30 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BNC2Q6ZN30 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BNC2Q6ZN30 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BNC2Q6ZN30 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BNC2Q6ZN30 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BNC2Q6ZN30 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BNC2Q6ZN30 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BNC2Q6ZN30 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNC2Q6ZN30 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNC2Q6ZN30 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BNC2Q6ZN30 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BNC2Q6ZN30 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BNC2Q6ZN30 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BNC2Q6ZN30 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BNC2Q6ZN30 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BNC2Q6ZN30 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BNC2Q6ZN30 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BNC2Q6ZN30 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BNC2Q6ZN30 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms