Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssxb10Q6XAR7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssxb10Q6XAR7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssxb10Q6XAR7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssxb10Q6XAR7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssxb10Q6XAR7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssxb10Q6XAR7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssxb10Q6XAR7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssxb10Q6XAR7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ssxb10Q6XAR7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ssxb10Q6XAR7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ssxb10Q6XAR7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ssxb10Q6XAR7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssxb10Q6XAR7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssxb10Q6XAR7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssxb10Q6XAR7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssxb10Q6XAR7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssxb10Q6XAR7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssxb10Q6XAR7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssxb10Q6XAR7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssxb10Q6XAR7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssxb10Q6XAR7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssxb10Q6XAR7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssxb10Q6XAR7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssxb10Q6XAR7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssxb10Q6XAR7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssxb10Q6XAR7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssxb10Q6XAR7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssxb10Q6XAR7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssxb10Q6XAR7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ssxb10Q6XAR7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssxb10Q6XAR7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssxb10Q6XAR7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssxb10Q6XAR7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssxb10Q6XAR7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssxb10Q6XAR7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssxb10Q6XAR7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssxb10Q6XAR7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssxb10Q6XAR7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssxb10Q6XAR7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssxb10Q6XAR7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssxb10Q6XAR7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssxb10Q6XAR7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssxb10Q6XAR7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssxb10Q6XAR7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssxb10Q6XAR7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssxb10Q6XAR7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssxb10Q6XAR7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssxb10Q6XAR7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssxb10Q6XAR7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssxb10Q6XAR7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssxb10Q6XAR7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssxb10Q6XAR7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssxb10Q6XAR7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssxb10Q6XAR7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssxb10Q6XAR7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssxb10Q6XAR7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssxb10Q6XAR7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssxb10Q6XAR7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssxb10Q6XAR7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssxb10Q6XAR7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssxb10Q6XAR7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssxb10Q6XAR7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssxb10Q6XAR7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssxb10Q6XAR7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssxb10Q6XAR7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssxb10Q6XAR7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssxb10Q6XAR7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssxb10Q6XAR7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssxb10Q6XAR7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssxb10Q6XAR7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssxb10Q6XAR7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssxb10Q6XAR7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssxb10Q6XAR7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssxb10Q6XAR7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssxb10Q6XAR7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssxb10Q6XAR7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssxb10Q6XAR7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ssxb10Q6XAR7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssxb10Q6XAR7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssxb10Q6XAR7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssxb10Q6XAR7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssxb10Q6XAR7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssxb10Q6XAR7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ssxb10Q6XAR7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ssxb10Q6XAR7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ssxb10Q6XAR7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ssxb10Q6XAR7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssxb10Q6XAR7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssxb10Q6XAR7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssxb10Q6XAR7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssxb10Q6XAR7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ssxb10Q6XAR7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ssxb10Q6XAR7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ssxb10Q6XAR7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ssxb10Q6XAR7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ssxb10Q6XAR7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ssxb10Q6XAR7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ssxb10Q6XAR7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ssxb10Q6XAR7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms