Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUC0

TFAP2E, Transcription factor AP-2-epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2EQ6VUC0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TFAP2EQ6VUC0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAP2EQ6VUC0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAP2EQ6VUC0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAP2EQ6VUC0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAP2EQ6VUC0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAP2EQ6VUC0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAP2EQ6VUC0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TFAP2EQ6VUC0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFAP2EQ6VUC0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFAP2EQ6VUC0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TFAP2EQ6VUC0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TFAP2EQ6VUC0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TFAP2EQ6VUC0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAP2EQ6VUC0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAP2EQ6VUC0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAP2EQ6VUC0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAP2EQ6VUC0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TFAP2EQ6VUC0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TFAP2EQ6VUC0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFAP2EQ6VUC0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFAP2EQ6VUC0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TFAP2EQ6VUC0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAP2EQ6VUC0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAP2EQ6VUC0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAP2EQ6VUC0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAP2EQ6VUC0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TFAP2EQ6VUC0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFAP2EQ6VUC0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFAP2EQ6VUC0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TFAP2EQ6VUC0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAP2EQ6VUC0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAP2EQ6VUC0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAP2EQ6VUC0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAP2EQ6VUC0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAP2EQ6VUC0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TFAP2EQ6VUC0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TFAP2EQ6VUC0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms