Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc88cQ6VGS5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc88cQ6VGS5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc88cQ6VGS5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc88cQ6VGS5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc88cQ6VGS5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc88cQ6VGS5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc88cQ6VGS5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc88cQ6VGS5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc88cQ6VGS5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc88cQ6VGS5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc88cQ6VGS5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc88cQ6VGS5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc88cQ6VGS5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc88cQ6VGS5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc88cQ6VGS5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc88cQ6VGS5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc88cQ6VGS5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc88cQ6VGS5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc88cQ6VGS5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc88cQ6VGS5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc88cQ6VGS5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc88cQ6VGS5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc88cQ6VGS5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc88cQ6VGS5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc88cQ6VGS5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc88cQ6VGS5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc88cQ6VGS5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc88cQ6VGS5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc88cQ6VGS5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc88cQ6VGS5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc88cQ6VGS5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc88cQ6VGS5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc88cQ6VGS5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc88cQ6VGS5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc88cQ6VGS5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc88cQ6VGS5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc88cQ6VGS5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc88cQ6VGS5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc88cQ6VGS5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc88cQ6VGS5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc88cQ6VGS5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc88cQ6VGS5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc88cQ6VGS5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc88cQ6VGS5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc88cQ6VGS5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc88cQ6VGS5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc88cQ6VGS5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc88cQ6VGS5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc88cQ6VGS5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc88cQ6VGS5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc88cQ6VGS5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc88cQ6VGS5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc88cQ6VGS5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc88cQ6VGS5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc88cQ6VGS5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc88cQ6VGS5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc88cQ6VGS5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc88cQ6VGS5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc88cQ6VGS5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc88cQ6VGS5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc88cQ6VGS5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc88cQ6VGS5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc88cQ6VGS5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc88cQ6VGS5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc88cQ6VGS5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc88cQ6VGS5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc88cQ6VGS5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc88cQ6VGS5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc88cQ6VGS5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms