Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD4L3Q6VB84 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD4L3Q6VB84 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD4L3Q6VB84 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD4L3Q6VB84 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD4L3Q6VB84 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXD4L3Q6VB84 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD4L3Q6VB84 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD4L3Q6VB84 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD4L3Q6VB84 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD4L3Q6VB84 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXD4L3Q6VB84 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FOXD4L3Q6VB84 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FOXD4L3Q6VB84 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FOXD4L3Q6VB84 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FOXD4L3Q6VB84 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FOXD4L3Q6VB84 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FOXD4L3Q6VB84 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FOXD4L3Q6VB84 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FOXD4L3Q6VB84 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FOXD4L3Q6VB84 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FOXD4L3Q6VB84 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOXD4L3Q6VB84 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOXD4L3Q6VB84 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOXD4L3Q6VB84 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOXD4L3Q6VB84 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOXD4L3Q6VB84 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FOXD4L3Q6VB84 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
FOXD4L3Q6VB84 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
FOXD4L3Q6VB84 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FOXD4L3Q6VB84 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOXD4L3Q6VB84 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOXD4L3Q6VB84 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXD4L3Q6VB84 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXD4L3Q6VB84 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXD4L3Q6VB84 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXD4L3Q6VB84 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXD4L3Q6VB84 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXD4L3Q6VB84 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXD4L3Q6VB84 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXD4L3Q6VB84 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXD4L3Q6VB84 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXD4L3Q6VB84 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXD4L3Q6VB84 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXD4L3Q6VB84 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOXD4L3Q6VB84 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOXD4L3Q6VB84 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXD4L3Q6VB84 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
FOXD4L3Q6VB84 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOXD4L3Q6VB84 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD4L3Q6VB84 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD4L3Q6VB84 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD4L3Q6VB84 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXD4L3Q6VB84 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FOXD4L3Q6VB84 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
FOXD4L3Q6VB84 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FOXD4L3Q6VB84 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
FOXD4L3Q6VB84 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
FOXD4L3Q6VB84 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
FOXD4L3Q6VB84 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
FOXD4L3Q6VB84 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
FOXD4L3Q6VB84 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
FOXD4L3Q6VB84 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FOXD4L3Q6VB84 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FOXD4L3Q6VB84 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
FOXD4L3Q6VB84 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FOXD4L3Q6VB84 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FOXD4L3Q6VB84 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FOXD4L3Q6VB84 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOXD4L3Q6VB84 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1003.1 ms