Protein–RNA interactions for Protein: Q6V4S5

Sdk2, Protein sidekick-2, mousemouse

Predictions only

Length 2,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdk2Q6V4S5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Sdk2Q6V4S5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sdk2Q6V4S5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sdk2Q6V4S5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdk2Q6V4S5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdk2Q6V4S5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sdk2Q6V4S5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdk2Q6V4S5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdk2Q6V4S5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sdk2Q6V4S5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sdk2Q6V4S5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdk2Q6V4S5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdk2Q6V4S5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdk2Q6V4S5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sdk2Q6V4S5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sdk2Q6V4S5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sdk2Q6V4S5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sdk2Q6V4S5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sdk2Q6V4S5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sdk2Q6V4S5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sdk2Q6V4S5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sdk2Q6V4S5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sdk2Q6V4S5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sdk2Q6V4S5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdk2Q6V4S5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdk2Q6V4S5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sdk2Q6V4S5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sdk2Q6V4S5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdk2Q6V4S5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdk2Q6V4S5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdk2Q6V4S5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdk2Q6V4S5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdk2Q6V4S5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sdk2Q6V4S5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdk2Q6V4S5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdk2Q6V4S5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sdk2Q6V4S5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sdk2Q6V4S5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sdk2Q6V4S5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdk2Q6V4S5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdk2Q6V4S5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdk2Q6V4S5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdk2Q6V4S5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdk2Q6V4S5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdk2Q6V4S5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdk2Q6V4S5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sdk2Q6V4S5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdk2Q6V4S5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdk2Q6V4S5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdk2Q6V4S5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sdk2Q6V4S5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sdk2Q6V4S5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdk2Q6V4S5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdk2Q6V4S5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdk2Q6V4S5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdk2Q6V4S5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdk2Q6V4S5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdk2Q6V4S5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdk2Q6V4S5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdk2Q6V4S5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sdk2Q6V4S5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdk2Q6V4S5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdk2Q6V4S5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sdk2Q6V4S5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sdk2Q6V4S5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdk2Q6V4S5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdk2Q6V4S5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sdk2Q6V4S5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdk2Q6V4S5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdk2Q6V4S5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdk2Q6V4S5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdk2Q6V4S5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdk2Q6V4S5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sdk2Q6V4S5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdk2Q6V4S5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdk2Q6V4S5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdk2Q6V4S5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdk2Q6V4S5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdk2Q6V4S5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdk2Q6V4S5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdk2Q6V4S5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdk2Q6V4S5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdk2Q6V4S5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdk2Q6V4S5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdk2Q6V4S5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdk2Q6V4S5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdk2Q6V4S5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdk2Q6V4S5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdk2Q6V4S5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdk2Q6V4S5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdk2Q6V4S5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdk2Q6V4S5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdk2Q6V4S5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdk2Q6V4S5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdk2Q6V4S5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdk2Q6V4S5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdk2Q6V4S5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdk2Q6V4S5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdk2Q6V4S5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdk2Q6V4S5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms