Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH9

PAMR1, Inactive serine protease PAMR1, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAMR1Q6UXH9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAMR1Q6UXH9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAMR1Q6UXH9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAMR1Q6UXH9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PAMR1Q6UXH9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PAMR1Q6UXH9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PAMR1Q6UXH9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PAMR1Q6UXH9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAMR1Q6UXH9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAMR1Q6UXH9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAMR1Q6UXH9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAMR1Q6UXH9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAMR1Q6UXH9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAMR1Q6UXH9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAMR1Q6UXH9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PAMR1Q6UXH9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAMR1Q6UXH9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAMR1Q6UXH9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAMR1Q6UXH9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAMR1Q6UXH9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAMR1Q6UXH9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PAMR1Q6UXH9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAMR1Q6UXH9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAMR1Q6UXH9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAMR1Q6UXH9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAMR1Q6UXH9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAMR1Q6UXH9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAMR1Q6UXH9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAMR1Q6UXH9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAMR1Q6UXH9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAMR1Q6UXH9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAMR1Q6UXH9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAMR1Q6UXH9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAMR1Q6UXH9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAMR1Q6UXH9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAMR1Q6UXH9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAMR1Q6UXH9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAMR1Q6UXH9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAMR1Q6UXH9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAMR1Q6UXH9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAMR1Q6UXH9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAMR1Q6UXH9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAMR1Q6UXH9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAMR1Q6UXH9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAMR1Q6UXH9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAMR1Q6UXH9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAMR1Q6UXH9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAMR1Q6UXH9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAMR1Q6UXH9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAMR1Q6UXH9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAMR1Q6UXH9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAMR1Q6UXH9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAMR1Q6UXH9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAMR1Q6UXH9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAMR1Q6UXH9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAMR1Q6UXH9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAMR1Q6UXH9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAMR1Q6UXH9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAMR1Q6UXH9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAMR1Q6UXH9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAMR1Q6UXH9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAMR1Q6UXH9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAMR1Q6UXH9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAMR1Q6UXH9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAMR1Q6UXH9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAMR1Q6UXH9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAMR1Q6UXH9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAMR1Q6UXH9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAMR1Q6UXH9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAMR1Q6UXH9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 506.9 ms